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16个鱼腥草基因型遗传多样性的SRAP分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
王坤;钟军;张丹丹;仇萍;曾维军
作者机构:
湖南农业大学生物科学技术学院
湖南农业大学农学院
[仇萍; 钟军; 曾维军] 湖南正清制药集团股份有限公司
[张丹丹; 王坤] 湖南农业大学
语种:
中文
关键词:
鱼腥草;优化;遗传多样性
关键词(英文):
SRAP
期刊:
作物研究
ISSN:
1001-5280
年:
2010
卷:
24
期:
1
页码:
30-35
基金类别:
基金项目:科技部国家科技基础条件平台建设项目(2004DKA30430)
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
农学院
生物科学技术学院
摘要:
2009年以16个鱼腥草为材料,通过正交设计研究了鱼腥草的SRAP-PCR反应体系和扩增体系,并运用SRAP标记技术构建了16个鱼腥草材料的SRAP-PCR图谱,同时应用DPS分析软件构建了UPGMA聚类图.结果表明:(1)最佳反应体系为总体积25 μL中含40 ng DNA,0.1 mmol/L dNTPs,2.0 mmol/L Mg2+,37.5 ng/μL引物和2 U Taq酶.(2)从360对引物中筛选出条带清晰多态性好的118对,共扩增出7 582个条带,其中多态性条带6 590个,多态率为86.92%.(3)ZY06-028在Me9-GA18扩增产物的250 bp处有特异性缺失带,而ZY06-016 和ZY06-028在550 bp处有特异性缺失带;在Me8-Em10的扩增产物中ZY06-42和ZY06-01分别在300 bp和450 bp处出现特异...
摘要(英文):
The SRAP amplified and reaction systems were researched and SRAP--PCR map of 16 genotypes of Houttuynia cordata Thunb were constructed and a UPGMA dendrogram was obtained by applying DPS software. The results were as follows: (1) The best reaction system was 40 ng DNA, 0. 1 mmol/L dNTPs, 2. 0 mmol/L Mg2+, 37. 5 ng/μL primer and 2 U Taq polymerase in 25 μL system. (2) 118 pairs of primers were selected from 360 pairs and 7 582 bands were amplified, of which 6 590 were polymorphic, and the polymorphic percentage of bands was 86. 92%. (3)...

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