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南荻CCoAOMT基因的克隆与生物信息学分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
洪艳云;黄志刚;易图永
作者机构:
[洪艳云; 黄志刚] 湖南农业大学生物科学技术学院
[易图永] 湖南农业大学生物安全技术学院
语种:
中文
关键词:
南荻;咖啡酰CoA-O-甲基转移酶;生物信息学分析;木质素
关键词(英文):
CCoAoMT;bioinformatics analysis;lign
期刊:
中南林业科技大学学报
ISSN:
1673-923X
年:
2011
卷:
31
期:
10
页码:
94-99
基金类别:
2010CB134403:国家重点基础研究发展计划(973计划) 07QN30:湖南农业大学青年项目
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
植物保护学院
生物科学技术学院
摘要:
南荻是一种高木质纤维素含量的禾本科多年生草本植物,但其中的高木质素含量严重制约了它作为能源植物的开发利用。采用RT-PCR及RACE方法从南荻中分离到G木质素单体形成的关键酶CCoAOMT家族的一个基因,将该基因序列递交到GenBank,登录号为JF965572。该基因全长工1206 bp,含有一个786 bp的阅读框,编码一个26laa的蛋白,分子量约为29 kD。通过NCBI在线比对发现该基因的预测蛋白与同为禾本科玉米的CCoAOMT酶蛋白有很高的同源性,最高达到94.0%;氨基酸序列多重比较的结果表明,该基因编码肽链含有CCoAOMT类基因全部的保守序列元件;系统进化树分析表明,该基因与玉米的CCoAOMT亲缘关系最近。
摘要(英文):
Triarrhena lutarioriparia L.Liou var.lutarioriparia has high lignocellulosic which can be convert into biofuel.The high content lignin seriously hampered its utilization as an energy plant.It is difficult to degrade lignin.Caffeoyl CoA-O-methyltransferase is a key enzyme for Triarrhena lutarioriparia L.Liou var.lutarioriparia to formate the G monomer.The caffeoyl CoA-O-methyl-transferase gene from Triarrhena lutarioriparia L.Liou var.lutarioriparia was cloned by RT-PCR and RACE(GenBank accession number: JF965572) and was analyzed from an ang...

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