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油菜钙依赖蛋白激酶BnCDPK1的克隆和表达分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
张秋平;文李;王峰;廖志强;李慧;...
作者机构:
湖南农业大学农学院,长沙410128
国家油料改良中心湖南分中心,长沙410128
长沙理工大学食品工程技术学院,长沙410114
[文李] 长沙理工大学
[官春云; 张秋平; 刘睿洋; 李慧; 廖志强] 国家油料改良中心
语种:
中文
关键词:
油菜;钙依赖蛋白激酶;基因克隆;基因表达;抗病
关键词(英文):
calcium-dependent protein kinase;gene cloning;gene expression;resistant to fugal
期刊:
植物遗传资源学报
ISSN:
1672-1810
年:
2014
卷:
15
期:
6
页码:
1320-1326
基金类别:
强优势油菜杂交种的创制与应用(2010BAD01B01) 油菜丰产高效栽培技术研究(2010BAD01B01)
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
农学院
摘要:
根据转录组测序获得的钙依赖蛋白激酶基因的EST序列设计特异引物,利用RT-PCR和RACE技术从油菜中克隆获得Bn CDPK1基因全长序列,NCBI登录号为KF740477,其c DNA和g DNA全长分别为2115 bp和2857 bp,含有11个内含子和12个外显子。生物信息学分析表明其开放阅读框为1581 bp,编码527个氨基酸,具有CDPKs家族典型的特征,含有1个激酶区域和4个钙离子手型结构域,与拟南芥At CDPK28同源性最高,属于第Ⅳ亚家族。Bn CDPK1在油菜的根、茎、叶、花、种子中均有表达,但表达丰度存在差异,叶片中表达量最高,其次为茎、根和种子,花中的表达量最低;在高抗和高感油菜品种中,菌核菌胁迫均能够诱导Bn CDPK1上调表达,但是...
摘要(英文):
The full length sequence of Bn CDPK1 was cloned from Brassica napus using RNA-Seq and rapid amplification of c DNA ends(RACE) techniques.Its c DNA was 2115 bp,and g DNA was 2857 bp which contained 11 introns and 12 exons.Bioinformatic analysis showed that Bn CDPK1 contained an entire opening reading frame of1581 bp,which encoded a polypeptide of 527 amino acid residues possessing a serine/threonine protein kinase catalytic domain(S_TKc) and four EF-hand calcium-binding domains,and it shared high identity with At CPK28 and belonged to the CD...

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