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DNA条形码在黄精属药用植物鉴定与遗传多样性分析中的应用

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成果类型:
期刊论文
作者:
龙炳宏;蒋向辉;宋荣;李胜华;肖龙骞;...
作者机构:
湖南农业大学生物科学技术学院,长沙410128
[佘朝文] 怀化学院民族药用植物资源研究与利用湖南省重点实验室,湖南怀化418000
湖南省农业科学院农业环境生态研究所,长沙410125
[佘朝文] 湖南工业大学生命科学与化学学院,湖南株洲412007
[宋荣] 湖南省农业科学院
语种:
中文
关键词:
黄精属;DNA条形码;遗传多样性
关键词(英文):
ITS;matK;rbcL;psbA-trnH;psbK-psbI
期刊:
植物科学学报
ISSN:
2095-0837
年:
2022
卷:
40
期:
4
页码:
533-543
基金类别:
湖南省自然科学基金(2019JJ40231)~~;
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
生物科学技术学院
摘要:
黄精属(Polygonatum)的许多物种具有重要的药用价值,但目前缺乏能够准确、高效地鉴定黄精属药用植物的DNA条形码.本研究通过对ITS、trnK-matK、rbcL、psbA-trnH和psbK-psbl序列进行扩增和测序,并从ITS序列中提取ITS2序列,共获得黄精属7个药用物种23份样品的138条序列.进一步比较6个DNA条形码对黄精属药用植物的鉴定效率,并验证所筛选条形码的可靠性.结果显示:trnK-matK的种内和种间变异重合少且有较明显的条形码间隙,其他5个序列的种内和种间变异重合多且无条形码间隙;BLAST结果表明trnK-matK的鉴定效率最高(85.7%),系统发育树显示trnK-matK的鉴定能力最强,能将全部12个多花黄精样品聚在一支,并...
摘要(英文):
Many species of the genus Polygonatum have important medicinal value,but there is currently a lack of DNA barcodes that can effectively identify medicinal plants within Polygonatum.In the present study,based on the amplification and sequencing of ITS,trnK-matK,rbcL,psbA-trnH,and psbK-psbI,and the extraction of the ITS2 sequences,138 sequences were obtained from 23 samples of seven Polygonatum medicinal species.Similarity search algorithm(BLAST)and neighbor-joining(NJ)analysis were used to compare the efficacy of sequences for identifying medicinal species and analysis of molecular variance(AMO...

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