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感染GCRV的草鱼miRNA测序与比较分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
肖调义;龙哲;李彬;张秋实;秦玲;...
通讯作者:
Xiong, S.-T.
作者机构:
[龙哲; 秦玲; 张秋实; 李彬; 肖调义; 熊舒婷] College of Animal Science and Technology, Hunan Agricultural University, Changsha, 410128, China
通讯机构:
[Xiong, S.-T.] C
College of Animal Science and Technology, China
语种:
中文
关键词:
草鱼;高通量测序;差异表达;组织表达
关键词(英文):
miRNAs
期刊:
水生生物学报
ISSN:
1000-3207
年:
2022
卷:
46
期:
2
页码:
238-247
基金类别:
国家自然科学基金项目(U20A2063); 湖南省自然科学基金项目(2020JJ5244); 农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室2019年开放课题资助项目(2019A02); 湖南农业大学校科学基金项目(19QN04)资助;
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
动物科学技术学院
摘要:
草鱼是我国人工养殖规模最大的大宗淡水鱼,草鱼呼肠孤病毒(Grass carp reovirus,GCRV)感染引起的草鱼出血病严重制约了草鱼的健康养殖,基于高通量筛选抗性主效miRNA功能分子的方法应用于抗性草鱼的选育值得探索。本研究借助高通量测序鉴定分析感染GCRV前后的草鱼头肾组织中miRNAs。测序结果共鉴定出821个成熟miRNAs,其中118个在GCRV攻毒组特异表达,82个为未攻毒组特有;差异分析结果显示,GCRV处理后有88个miRNA显著下调表达、46个miRNA显著上调表达;qPCR结果显示miR-21在GCRV感染组中的头肾中表达量最高,miR-194a在两个比较组中的差异倍数最大,达到48倍之高;组织表达结果发现部分差...
摘要(英文):
Grass carp (Ctenopharyngodon idellus) which has importantly economic value is the most cultured freshwater fish in China, even in the world. The hemorrhagic disease caused by grass carp reovirus (GCRV) has greatly affected the sustainable development of grass carp aquaculture. GCRV vaccine is an important method to prevent and control hemorrhagic disease, but the multi-subtype and variation characteristics of GCRV limit the preventive effect of GCRV vaccine. Organismal immune ability is closely related to genetic factors, so many progresses hav...

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