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高油酸油菜成熟期种子转录组分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
张振乾;常涛;王晓丹;王峰;王国槐;...
作者机构:
湖南农业大学农学院, 南方粮油作物协同创新中心, 长沙, 410128
农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室, 农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室, 武汉, 430062
[张振乾] 湖南农业大学农学院, 南方粮油作物协同创新中心, 长沙, 410128 农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室, 农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室, 武汉, 430062
[常涛; 王晓丹; 王峰; 王国槐; 邬贤梦; 官春云] 湖南农业大学农学院, 南方粮油作物协同创新中心, 长沙, 410128
[胡琼] 农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室, 农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室, 武汉, 430062
语种:
中文
关键词:
高油酸油菜;转录组;定量PCR
期刊:
分子植物育种
ISSN:
1672-416X
年:
2018
卷:
16
期:
6
页码:
1731-1745
基金类别:
973项目(2015CB150206); 国家自然科学基金(31201240); 湖南省科技重大专项(2014FJ1006); 农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室开放课题(2014008); 作物种质创新与资源利用国家重点实验室培育基地开放课题(ZWKF201302); “十三五”国家重点研发计划(2016YFD0101300)共同资助;
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
农学院
摘要:
为了找出差异基因用于高油酸油菜育种,对两个油酸含量不同的高油酸油菜材料(油酸含量分别为84.4%和56.2%)成熟期种子进行转录组分析和实时荧光定量PCR分析。IlluminaHiseq~™2000测序得到8.09 Gb cleanreads,组成52 361个unigene,平均长度为659bp。比对公共数据库得到48 911 (93.41%)个氨基酸序列。鉴定出6 414个在高油酸油菜和低油酸油菜中差异显著的基因,这些基因有1 296个在高油酸油菜中上调表达(20.21%),5 118个下调表达(79.79%),共有2 043个差异基因在119个代谢通路中富集表达。将其中14个与脂肪酸代谢和光合作用相关基因进行荧光定量PCR验证。Bna0799930,Bna0104450和Bna0305890在高油酸油...
摘要(英文):
To identify differentially expressed genes (DEGs) potentially beneficial for breeding high oleic acid rapeseed, two rapeseed (Brassica napus L.) lines with different levels of oleic acid (81.4% and 56.2%) were subjected to transcriptome sequencing and quantitative real-time PCR (qRT-PCR) analysis. Using Illumina paired-end sequencing, we obtained approximately 8.09 Gb of clean reads which were assembled into 52 361 unigene, with an average length of 659 bp. Compared to the public database, 48 911 (93.41%) amino acid sequences were obt...

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