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水稻Cu/Zn-SOD基因的克隆、表达及生物信息学分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
骆鹰;谢旻;张超;王伟平;朱建华;...
作者机构:
[骆鹰] 湖南农业大学生物科学技术学院,长沙,410128
[骆鹰] 湖南科技学院化学与生物工程学院,永州,425199
湖南杂交水稻研究中心,杂交水稻国家重点实验室,长沙,410125
[王伟平; 张超] 湖南杂交水稻研究中心
[朱建华; 饶力群; 谢旻; 汪启明] 湖南农业大学
语种:
中文
关键词:
水稻;铜锌超氧化物岐化酶基因;克隆;表达;生物信息学分析
关键词(英文):
Cu/Zn superoxide dismutase gene;Cloning;Expression;Bioinformatics analysis
期刊:
分子植物育种
ISSN:
1672-416X
年:
2018
卷:
16
期:
10
页码:
3097-3105
基金类别:
国家自然基金(31301081) 科技部国家科技支撑计划项目(2014BAD01B04) 教育部博士点基金项目(20134320120009) 湖南省高校创新平台开放基金项目(13K063) 湖南省自然科学基金项目(2018JJ2144) 湘南优势植物资源综合利用湖南省重点实验室资助项目(湘南植物[2015]1号)共同资助
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
生物科学技术学院
摘要:
为了探究水稻铜锌超氧化物岐化酶基因(OsCu/Zn-SOD)的功能,以水稻品种日本晴(Oryza sativa japonica)为材料,采用同源克隆法获得OsCu/Zn-SOD,并对其进行表达及生物信息学分析。结果表明,OsCu/Zn-SOD基因cDNA序列为606 bp,编码152个氨基酸,CDS区459 bp,碱基组成A为22.7%、T为24.4%、G为29.4%、C为23.5%。OsCu/Zn-SOD蛋白表现为弱酸性,且稳定、亲水;二级结构中以无规则卷曲和延伸链结构为主,三级结构同源建模成功,主要是螺旋和转角;亚细胞定位OsCu/Zn-SOD主要分布在细胞质中,推测可能在翻译、运输结合和能量代谢过程中发挥重要作用,无跨膜结构域,无信号肽;该蛋白序列中存在8个丝氨酸磷酸化,4个苏氨...
摘要(英文):
In order to explore the function of Cu/Zn Superoxide Dismutase Gene (OsCu/Zn-SOD) in rice, OsCu/Zn-SOD was obtained by homology cloning method, and was further carried out with expressions and bioinformatic analysis with Oryza sativa as the material. The result showed that the cDNA sequence of OsCu/Zn-SOD was 606 bp, encoding a protein of 152 amino acids. The CDS region of OsCu/Zn-SOD was 459 bp whose compositions of basic group were 22. 7% of A, 24. 4% of T, 29. 4% of G and 23. 5% of C. The OsCu/Zn-SOD protein was stable, hydrophilic and m...

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