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水稻三结构域多铜氧化酶基因家族生物信息学分析 <&wdkj&>Bioinformatics Analysis on the Gene Family of Three-domain Multi-copper Oxidases in Rice

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成果类型:
期刊论文
作者:
王有成;谭炎宁;张超;殷小林;何强;...
作者机构:
湖南农业大学农学院
[谭炎宁; 张超; 何强] 湖南杂交水稻研究中心
湖南大学研究生院隆平分院
[肖应辉; 邓华凤; 王有成] 湖南农业大学
[殷小林] 湖南大学
语种:
中文
关键词:
水稻;多铜氧化酶;基因家族;结构域;生物信息学分析
关键词(英文):
Multi-copper oxidase;Gene family;Domain;Bioinformatics analysis
期刊:
分子植物育种
ISSN:
1672-416X
年:
2019
卷:
17
期:
5
页码:
1385-1392
基金类别:
2014AA10A604:国家高技术研究发展计划(863计划) 2017XC09:湖南农业科技创新资金共同资助
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
农学院
摘要:
三结构域多铜氧化酶是生物体内非常重要的金属氧化酶,对机体生长和发育具有重要影响。为了系统地了解水稻三结构域多铜氧化酶基因家族的基本情况,本研究运用生物信息学方法对其成员进行了预测和分析;研究发现,以拟南芥三结构域多铜氧化酶基因At5g21105为靶序列,利用BlastP为工具在水稻基因组中共搜索到38个同源基因;这些基因的蛋白产物都依次含有Cu-oxidase3、Cu-oxidase和Cu-oxidase2三种结构域,各结构域中含有铜离子结合位点,二级结构具有α-螺旋和β-转角等基本特征,特推断它们都属于三结构域多铜氧化酶家族成员;进一步地,根据同源性程度将水稻多铜氧化酶基因家族成员划分为ClassⅠ和ClassⅡ...
摘要(英文):
Three-domain multi-copper oxidases, a very important metal oxidase in organism, are essential for the growth and development of organism. In order to understand the basic situation of multi-copper oxidase gene family in rice, in this study, bioinformatics methods were used to predict and analyze its family members. By performing a program of BlastP with a target sequence of At5g21105 encoding a three-domain multi-copper oxidase, 38 homologous proteins were identified from rice genome. Furthermore, these proteins products of these genes were pre...

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