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皱边石杉内生真菌ISSR-PCR反应条件的优化

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成果类型:
期刊论文
作者:
史云峰;禹利君;刘仲华;黄璜;胥锦桦;...
作者机构:
[史云峰] 湖南农业大学东方科技学院
[黄璜] 湖南农业大学农学院
[禹利君; 刘仲华; 胥锦桦; 朱楠楠] 国家植物功能成分利用工程技术研究中心
茶学教育部重点实验室
语种:
中文
关键词:
皱边石杉;内生真菌;内部简单重复序列;正交试验
关键词(英文):
Huperzia crispata;endophytic fungi;inter simple sequence repeat (ISSR);orthogonal design
期刊:
湖南农业大学学报(自然科学版)
ISSN:
1007-1032
年:
2012
卷:
38
期:
4
页码:
398-403
基金类别:
湖南省自然科学基金项目(11JJ3040); 湖南省大学生科技创新研究项目(DFCXS201003);
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
农学院
东方科技学院
摘要:
以从皱边石杉中分离纯化出的99株内生真菌DNA为材料,优选出10条ISSR引物(UBC842、UBC848、UBC850、UBC856、UBC861、UBC864、UBC868、UBC873、UBC880、UBC887)的最适退火温度,并对其进行ISSR–PCR反应体系单因素试验及正交试验优化,建立皱边石杉内生真菌ISSR–PCR的优化反应体系,即25μL反应体系中,10×PCR Buffer(Mg~(2+)浓度为2.0 mmol/L)2.5μL,dNTPs(10 mmol/L)0.6μL,引物(10 pmol/μL)2.0μL,Taq E(1 U/μL)1.5μL,DNA模板(10 ng/μL)3μL,无菌ddH_2O 15.4μL。以UBC873引物对99株内生真菌基因组DNA进行PCR扩增,初步获知皱边石杉内生真菌资源的遗传多样性非常丰富。
摘要(英文):
DNAs were extracted from 99 endophytic fungi isolated from Huperzia crispata and the best annealing temperatures of 10 primers (UBC842, UBC848, UBC850, UBC856, UBC861, UBC864, UBC868, UBC873, UBC880 and UBC887) were determined for optimization of ISSR-PCR amplification of endophytic fungi from Huperzia crispate through single factor test and orthogonal design. The result showed that the optimal ISSR-PCR reaction volume was 25 p.L, containing 2.5 μL of 10×PCR Buffer (2.0 mmol/L Mg^2+), 0.6 p.L of dNTPs (10 mmol/L), 2.0 μL of primer (1...

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