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十字花科植物17个物种PIN3基因的系统进化分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
汤宾;李玉军;赵燕;黄丽华;黄妤;...
作者机构:
[汤宾; 李玉军; 赵燕; 黄丽华; 黄妤; 张学文] 湖南农业大学生物科学技术学院, 湖南, 长沙, 410128
语种:
中文
关键词:
十字花科;PIN3基因;系统进化
关键词(英文):
Brassicaceae;PIN3 gene;phyletic evolution
期刊:
湖南农业大学学报(自然科学版)
ISSN:
1007-1032
年:
2017
卷:
43
期:
4
页码:
366-371
基金类别:
湖南省教育厅高校重点实验室开放项目(15K060);
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
生物科学技术学院
摘要:
为了探明十字花科植物不同物种PIN3基因之间的进化差异,运用Brassica Database数据库及十字花科基因数据库在线平台,对拟南芥(Arabidopsis thaliala)、红花荠菜(Capsella rubella)、芜青(Brassica rapa)、油菜(Brassica napus)、甘蓝(Brassica oleracea)等17个已完成基因组测序的十字花科物种的18个(油菜含有2个)PIN3同源性基因进行分析,并对其推导的编码蛋白(PIN3)进行了系统进化分析。结果表明,18个PIN3序列间的相似性为86.74%,PIN3推导蛋白之间的相似度为90.93%,蛋白等电点约为7.15~9.44,芜青PIN3等电点明显偏高。 PIN3的氨基酸比对分析结果表明,在多个糖基化位点出现具有种属差异性和符合进...
摘要(英文):
In order to explore the evolutionary differences between PIN3 genes in different species of Brassicaceae, the Brassica database and the Brassicaceae gene database were used. In this paper 18 PIN3 genes were identified by sequences blast in the database of 17 sequenced Brassicaceae species (there were two homologous PIN3 in Brassica napus). The phylogenetics of the genes and their predicted proteins (PIN3) were carried out by bioinformatics analysis. The results indicated that the similarity of 18 PIN3 gene sequences in the Brassicaceae species was 86.74%, while the proteins similarity was 90.9...

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