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水稻OsSSRP的生物信息学分析及耐盐性研究

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成果类型:
期刊论文
作者:
曾佳;刘玲;周天顺;荣秀琴;袁定阳;...
作者机构:
[曾佳] 湖南农业大学生物科学技术学院
[刘玲; 荣秀琴] 湖南农业大学农学院
[周天顺] 湖南大学研究生院隆平分院
[袁定阳] 湖南杂交水稻研究中心
湖南农业大学生物科学技术学院,,湖南农业大学农学院
语种:
中文
关键词:
水稻;激素响应;RR家族基因;生物信息学;耐盐性
关键词(英文):
rice;hormone response;response regulators family genes;bioinformatic;salt-tolerance
期刊:
湖南农业大学学报(自然科学版)
ISSN:
1007-1032
年:
2022
卷:
48
期:
2
页码:
151-159
基金类别:
国家自然科学基金面上项目(31771767); 湖南省科技人才托举工程项目(2019TJ–Q08); 湖南省科技重大专项(2018NK1010);
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
农学院
生物科学技术学院
摘要:
为鉴定水稻RR(response regulators)家族成员OsSSRP(salt–sensitive RR protein,LOC_Os08g35670)是否响应盐胁迫,以日本晴为背景材料,采用Blast比对、结构域预测和启动子元件分析等方法,分析发现OsSSRP仅含REC结构域基序,其启动子元件中含有大量脱落酸和茉莉酸响应元件;诱导表达谱分析发现,OsSSRP响应盐和干旱逆境胁迫及细胞分裂素、脱落酸和茉莉酸诱导;利用CRISPR / Cas9技术定向敲除后获得纯合突变体ssrp,通过0、40、100 mmol/L NaCl进行种子萌发期盐胁迫处理和150 mmol/L NaCl的苗期耐盐性鉴定,发现纯合突变体ssrp对盐胁迫更为敏感,盐胁迫后纯合突变体ssrp存活率远远低于野...
摘要(英文):
To identify whether the RR family member Os SSRP(salt-sensitive RR Protein,LOC_Os08g35670)of rice was response to salt stress,using the nipponbare as the material,we employed bioinformatics analysis including gene blast,domain prediction and promoter analysis of their sequences.It showed that Os SSRP contained only REC domain motif,and its promoter elements possessed large number of abscisic and jasmonic acid responsive elements.Induced expression profile analysis found that Os SSRP responded to salt and drought stress and induction of cytokinin,abscisic acid,and jasmonic acid.After seedling s...

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