期刊论文

Xie, B.

中文

生物工程学报

1000-3061

2011

27

1

41-51

10.13345/j.cjb.2011.01.013

国家重点基础研究发展计划（973计划）（No.2009CB119000） 公益性行业（农业）科研专项经费（No.nyhyzx07-050） 国家“十一五”国家科技支撑计划（Nos.2006BAD07B03 2006BAD08A08 2006BAD17B08）资助

本校为其他机构

土壤古菌和真菌在温室生态系统是仅次于细菌的微生物,具有类似于细菌的重要生态功能。通过构建古菌16S rRNA和真菌18S rRNA基因克隆文库,分析温室黄瓜近根土壤古菌和真菌群落结构组成,为开发利用温室这一特殊的生态环境中丰富的微生物资源以及理解微生物与植物间的互作提供参考依据。采用研磨-冻融-溶菌酶-蛋白酶K-SDS热处理以及CTAB处理等理化方法,提取和纯化微生物总DNA,构建古菌16S rRNA和真菌18S rRNA基因克隆文库。利用DOTUR软件将古菌和真菌序列按照相似性97%的标准分成若干个可操作分类单元（OTUs）。土壤古菌克隆文库主要包括泉古菌门和未分类的古菌两大类,并有少部分广域古菌类群,所有...

Soil archaea and fungi play important roles in the greenhouse soil ecosystem. To develop and apply rich microbial resources in greenhouse ecological environment, and to understand the interaction between microbes and plants, we constructed archaeal 16S rRNA and fungal 18S rRNA gene libraries to analyze the compositions of archaeal and fungal communities. Total greenhouse soil DNA was directly extracted and purified by skiving-thawing-lysozyme-proteinase K-SDS hot treatment and treatment of cetyltriethylammnonium bromide (CTAB). After PCR amplification, retrieving, ligating, transforming, scree...