版权说明 操作指南
首页 > 成果 > 详情

整合mRNA转录本与基因组信息的基因组选择方法研究

认领
导出
Link by 中国知网学术期刊
反馈
分享
QQ微信 微博
成果类型:
期刊论文
作者:
胡玉龙;杨芳;陈彦潼;谌烁楷;闫煜博;...
作者机构:
[高宁; 闫煜博; 张跃博; 胡玉龙; 陈彦潼; 何俊; Shen, Shuo-Kai; 杨芳] College of Animal Science and Technology, Hunan Agricultural University, Changsha 410125, China
[吴晓林] Council on Dairy Cattle Breeding, Bowie, MD 20716, USA
[吴晓林] Department of Animal and Dairy Sciences, University of Wisconsin, Madison, WI 53706, USA
[汪加明] Hunan Xinwufeng Co., Ltd, Changsha 410005, China
语种:
中文
关键词:
基因组选择;基因组预测;mRNA转录本;整合组学
关键词(英文):
genomic prediction;genomic selection;integrative omics;mRNA transcripts
期刊:
遗传
ISSN:
0253-9772
年:
2024
卷:
46
期:
07
页码:
560-569
基金类别:
国家自然科学基金项目(编号:32002148); 湖南省教育厅资助科研项目(编号:22B0219); 湖南省自然科学基金项目(编号:2022JJ30286);
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
动物科学技术学院
摘要:
基因组预测已成为畜禽、作物遗传评估和人类疾病风险预测的主要技术,但经典的基因组预测方法在性状遗传调控机制等生物学先验信息的整合方面有一定的不足。本研究提出一种将mRNA转录本信息整合应用于复杂性状表型预测的方法。基于国际上广泛应用于数量遗传学研究的果蝇群体,对本研究提出的新方法进行准确性评估。结果显示,整合mRNA转录本,可有效提高部分性状基因组预测准确性,但对部分性状的表型预测准确性没有改善。与GBLUP相比,雄性果蝇D-香芹酮嗅觉反应(dCarvone)准确性由0.256提高到0.274,提高幅度7%。雄性果蝇咖啡因耐受反应(cafe)准确性由0.355提高到0.401,提高幅度13%。雄性果蝇...
摘要(英文):
Genomic prediction has emerged as a pivotal technology for the genetic evaluation of livestock, crops, and for predicting human disease risks. However, classical genomic prediction methods face challenges in incorporating biological prior information such as the genetic regulation mechanisms of traits. This study introduces a novel approach that integrates mRNA transcript information to predict complex trait phenotypes. To evaluate the accuracy of the new method, we utilized a Drosophila population that is widely employed in quantitative genetics researches globally. Results indicate that inte...

反馈

验证码:
看不清楚,换一个
确定
取消

成果认领

标题:
用户 作者 通讯作者
请选择
请选择
确定
取消

提示

该栏目需要登录且有访问权限才可以访问

如果您有访问权限,请直接 登录访问

如果您没有访问权限,请联系管理员申请开通

管理员联系邮箱:yun@hnwdkj.com