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高油酸油菜脂肪酸代谢的蛋白质组学与转录组学关联分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
王晓丹;肖钢;常涛;张振乾;官春云;...
作者机构:
[王晓丹; 肖钢; 常涛; 张振乾; 官春云; 邬贤梦] 湖南农业大学农学院, 南方粮油作物协同创新中心, 湖南, 长沙, 410128
语种:
中文
关键词:
蛋白质组学;转录组学;关联分析;高油酸油菜;脂肪酸代谢
关键词(英文):
Proteomics;Transcriptomics;Association analysis;High oleic rapeseed;Fatty acid metabolism
期刊:
华北农学报
ISSN:
1000-7091
年:
2017
卷:
32
期:
6
页码:
31-36
基金类别:
国家“973”计划项目(2015CB150206); 国家自然科学基金项目(31201240); 湖南省科技重大专项(2014FJ1006); 作物种质创新与资源利用国家重点实验室培育基地开放课题; 湖南农业大学作物学开放基金项目(ZWKF201302);
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
农学院
摘要:
为了解高油酸油菜脂肪酸代谢的调控机理,以一组高油酸近等基因系自交授粉后20 ~ 35 d的种子为材料,进行同位素相对标记技术与绝对定量技术关联转录组分析。结果表明:蛋白质组和转录组相关性并不高,定量蛋白和基因关联系数为-0. 326 9;变化趋势相反差异蛋白和基因的表达关联系数为-0. 735 8;变化趋势相同差异蛋白和基因的表达关联系数为0. 714 3。此外,鉴定出与差异蛋白表达趋势相同的差异基因80个,GO注释表明,这些基因涉及代谢、信号转导、防御与胁迫应答、氧化还原、转录等方面的功能,其中与脂肪酸代谢过程相关的有23个,上调表达16个,下调表达7个。gi |297330358(庚二酰ACP甲基酯的羧酸酯酶) 、...
摘要(英文):
In order to study the regulation mechanism of fatty acid metabolism in high oleic rapeseed,a group of highly oleic acid near-isogenic lines was used as the material from 20 to 35 days after pollination,and was discussed by isobaric tags for relative and absolute quantitation with transcriptome technology. The results showed that the correlation coefficient between protein and transcript group was not high,and the correlation coefficient between quantitative protein and gene was-0. 326 9. The correlation coefficient of differential protein and gene expression was-0. 735 8,and the correlation co...

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