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芥菜型油菜AHK家族成员的全基因组鉴定及调控粒质量性状的初步探索

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成果类型:
期刊论文
作者:
游亮;陈浩;肖华贵;梁峰豪;张超;...
作者机构:
[游亮] 贵州省油料研究所,贵州贵阳 550006
[游亮] 湖南人文科技学院农业与生物技术学院,湖南 娄底 417000
[游亮] 湖南农业大学,湖南 长沙 410128
[唐容; 肖华贵; 张超; 王璐璐; 杨斌; 梁峰豪] 贵州省油料研究所
[陈浩] 湖南农业大学
语种:
中文
关键词:
芥菜型油菜;AHK家族;粒质量性状;表达分析
期刊:
华北农学报
ISSN:
1000-7091
年:
2024
卷:
39
期:
01
页码:
8-17
基金类别:
:黔科合基础-ZK :一般项目 CARS-12:国家油菜产业技术体系项目 GZCYTX2018-08:贵州省油菜产业技术体系 202304:黔农科院种质资源
机构署名:
本校为其他机构
摘要:
为探究芥菜型油菜AHK家族蛋白的结构特征及其与粒质量性状相关的调控功能,采用生物信息学方法对芥菜型油菜AHK家族成员进行了全基因组鉴定、理化性质、系统发育树、蛋白结构、启动子顺式元件和不同组织表达谱等分析.结果表明,在芥菜型油菜基因组中共鉴定到19条BjAHK蛋白序列,系统发育树分析将BjAHK家族成员分为了4个分支,即 G1(BjAHK2~BjAHK4)、G2(BjAHK5)、G3(BjAHK1)和 G4(BjCKI1).功能结构域研究发现,BjAHK 家族成员具有6个核心基序(Motif1~Motif6),与HisKA、HATPase_c和REC保守结构域相对应,其中BjAHK1~BjAHK4和BjCKI1蛋白的N端含有较为保守的跨膜结构域,可能与其跨膜作用功能有关.不同组...
摘要(英文):
In order to investigate the structural characteristics of Brassica juncea AHK family proteins and their regulatory functions related to seed weight traits,it employed bioinformatics methods to perform whole-genome iden-tification,physicochemical properties analysis,phylogenetic tree construction,protein structure analysis,promoter cis-elements analysis,and differential tissue expression profiling of the BjAHK family members.The main findings were as follows:a total of 19 BjAHK protein sequences were identified from the B.juncea genome,and phylogenetic analysis classified the BjAHK family membe...

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