期刊论文

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畜牧兽医学报

0366-6964

2017

48

7

1181-1190

10.11843/j.issn.0366-6964.2017.07.002

国家科技支撑计划项目（2015BAD03B02-2） 中国农业科学院科技创新工程（ASTIP-IAS02） 国家生猪产业技术体系（CARS-36）

本校为第一机构

旨在将尾分析法与全基因组关联分析相结合,初步确定两尾选择的标准。首先,对样本量为2 000、1 500、 1 000、500的群体进行全基因组关联分析(GWAS),探索群体规模大小对GWAS结果的影响,然后对各样本量两尾的20%、15%、12%、10%、8%、5%进行GWAS,探索两尾比例的大小对GWAS结果的影响。研究结果表明,检测出的显著关联SNP数目随群体规模及两尾比例的减小而减少。初步确定两尾选择标准为:遗传力为0.38左右的性状,样本量为2 000、1 500、1 000、500,两尾选择比例分别为8%、10%、10%、20%;遗传力为0.50左右的性状,样本量为2 000、1 500、1 000、500,两尾选择比例分别为5%、5%、10%、15%。以此标准为基础...

Tail analysis and genome-wide association studies(GWAS) were combined in this study to determine preliminary two tails selection criterions.A total of 2 000,1 500,1 000 and 500 samples and 20％,15％,12％,10％,8％,5％ of two tails were used to run GWAS to estimate the effects of the population size on GWAS and the effect of the proportion of two tails on GWAS,respectively.The results showed that the number of significant SNPs decreased with the reducing population size and the proportion of two tails.The preliminary selection criterions were:tra...