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基于转录组分析猪链球菌抗氧化应激相关基因表达的变化

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成果类型:
期刊论文
作者:
曹锟;杨磊;杨鹏江;陈如泓;柳泰;...
作者机构:
[曹锟; 杨磊; 杨鹏江; 陈如泓; 柳泰; 余兴龙] 湖南农业大学动物医学院
语种:
中文
关键词:
猪链球菌;转录组;氧化应激
期刊:
基因组学与应用生物学
ISSN:
1674-568X
年:
2023
卷:
42
期:
05
页码:
518-527
基金类别:
国家自然科学基金面上项目(31972713)资助;
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
动物医学院
摘要:
本研究通过转录组测序技术研究猪链球菌(Streptococcus suis)经H2O2处理后的全基因组转录水平变化,探究氧胁迫下与猪链球菌应对氧化应激过程相关的代谢通路和基因。将9型猪链球菌DN13菌株培养至对数生长后期,用PBS和H2O2分别处理15 min,将处理后的DN13菌株进行转录组测序(RNA-seq),对转录本中的差异表达基因进行KEGG和GO分析,并用实时定量PCR(real-time quantitative PCR, RT-qPCR)验证RNA-seq的分析结果。RNA-seq结果显示,DN13共检测到2 005个基因,与对照组相比,实验组有749个基因差异表达,占比37.4%。GO富集结果表明,差异表达基因在分子功能、生物学过程和细胞组分这3大类中均显...

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