版权说明 操作指南
首页 > 成果 > 详情

泥东风螺EST-SSR开发及其群体遗传多样性分析

认领
导出
Link by 中国知网学术期刊 Link by 万方学术期刊
反馈
分享
QQ微信 微博
成果类型:
期刊论文
论文标题(英文):
Development and Genetic Diversity Analysis of Babylonia lutosa with EST-SSR Markers
作者:
熊钢,;王晓清;王佩;陈贞年;周先文,;...
作者机构:
湖南生物机电职业技术学院动物科技系
湖南农业大学动物科技学院
湘西州水产工作站
[曾志南] 福建省水产研究所
[熊钢,; 康骊] 湖南生物机电职业技术学院
语种:
中文
关键词:
泥东风螺;转录组;遗传多样性
关键词(英文):
EST-SSR
期刊:
渔业科学进展
ISSN:
2095-9869
年:
2020
卷:
41
期:
4
页码:
117-124
基金类别:
201205021:海洋公益性行业科研专项 31672640:国家自然科学基金 2017JJ3134:湖南省自然科学基金 2016NK2115:湖南省自然科学基金 17C0935:湖南省教育厅项目
机构署名:
本校为其他机构
院系归属:
动物科学技术学院
摘要:
本研究采用MISA软件分析泥东风螺(Babylonia lutosa)转录组中微卫星信息。结果显示,从转录组中共获得16324个SSR,共有181种重复基元;泥东风螺转录组中不同类型微卫星的重复基元具有不同的分布特征,其中,二核苷酸重复基元中AC/GT(70.58%)重复基元以重复6次出现频率占优;长度为12~20bp的SSR占63.95%,长度为21~25bp的SSR占9.14%,总体的平均长度为18.4bp。随机选取其中50条序列设计引物,通过对福建野生泥东风螺群体(WP)DNA样本进行PCR扩增和分型,结果获得23个多态性位点,等位基因数目为2~7个不等,期望杂合度(N_e)为0.190~0.937,观察杂合度(N_o)为0.065~0.936,多态性信息含量(PIC)为0.061~0.777,有4个...
摘要(英文):
Babylonia lutosa is a marine shellfish that has high economic values.In recent decades,the natural resource of B.lutosa has declined due to the environment destruction and overfishing.To further understand the level of genetic diversity and population genetic structure of B.lutosa,we have evaluated the information characteristics of B.lutosa's microsatellites,after obtaining transcriptome sequences using MISA software.The results show that a total of 16342 microsatellites and 181 nucleotide repeat motifs were identified.Different types of repeat microsatellites had considerably different distr...

反馈

验证码:
看不清楚,换一个
确定
取消

成果认领

标题:
用户 作者 通讯作者
请选择
请选择
确定
取消

提示

该栏目需要登录且有访问权限才可以访问

如果您有访问权限,请直接 登录访问

如果您没有访问权限,请联系管理员申请开通

管理员联系邮箱:yun@hnwdkj.com