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不同性别黄瓜EIN3基因片段克隆及序列分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
刘晓虹;陈惠明;许亮;许勇;张海英;...
作者机构:
[陈惠明] 湖南省蔬菜研究所,长沙,410125
[陈惠明] 湖南农业大学生物科学技术学院
湖南农业大学生物科学技术学院,长沙,410128
[许勇; 张海英] 国家蔬菜工程技术研究中心
[卢向阳; 许亮] 湖南农业大学
语种:
中文
关键词:
基因克隆;黄瓜;性别表达
关键词(英文):
EIN3
期刊:
中国蔬菜
ISSN:
1000-6346
年:
2008
期:
9
页码:
10-14
基金类别:
国家科技基础性工作专项(2006FY11070902);
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
生物科学技术学院
摘要:
根据GenBank植物EIN3基因家族的保守序列设计了1对引物,以纯雌性系、强雌性系、雌雄同株系、两性花株系的不同性别黄瓜总DNA为模板,经PCR扩增得到6个725 bp左右的基因片段并进行序列比较分析.结果表明,不同性型黄瓜肭基因编码区有14个SNPs,平均51 bp发现1个SNP,检出率为1.96%;其中有3个酶切位点突变,且发现编码区的SNPs有8个突变导致了氨基酸改变;初步建立了1个RFLP-Bfm I的酶切体系,发现在两性花株WI1983H中出现特异的酶切条带.
摘要(英文):
A pair of oligonucleotide primers was designed from conserved domain of EIN3 gene family. PCR amplifications were performed on different sex genotype cucumber DNA template and produced 6 fragments of 725 bp, respectively. After cloning and sequencing on CsEIN3 of different sex genotype cucumbers, BLAST and DNAMAN analysis found 14 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in coding region, about one average 51 bp, selection rating 1.96 % , 3 mutation in enzyme digested site, eight SNPs mutation cause amino acid sequence variation. One set of sta...

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