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基于SCoT标记的洞庭湖区南荻种质资源的遗传多样性研究

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成果类型:
期刊论文
作者:
钱茱希;薛帅;郭孟奇;许磊;杨塞
作者机构:
湖南农业大学东方科技学院, 湖南, 长沙, 410128
芒属植物生态应用湖南省工程实验室, 芒属植物生态应用湖南省工程实验室, 湖南, 长沙, 410128
[钱茱希; 许磊] 湖南农业大学东方科技学院, 湖南, 长沙, 410128
[薛帅; 郭孟奇] 芒属植物生态应用湖南省工程实验室, 芒属植物生态应用湖南省工程实验室, 湖南, 长沙, 410128
[杨塞] 湖南农业大学东方科技学院, 湖南, 长沙, 410128 芒属植物生态应用湖南省工程实验室, 芒属植物生态应用湖南省工程实验室, 湖南, 长沙, 410128
语种:
中文
关键词:
南荻;遗传多样性
关键词(英文):
SCoT
期刊:
中国草地学报
ISSN:
1673-5021
年:
2018
卷:
40
期:
3
页码:
14-19,48
基金类别:
湖南省大学研究性学习与创新性实验计划项目(DFCXS201603) 湖南农业大学重大科研项目暨创新团队培育工程资助项目(17PYXM02)
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
东方科技学院
摘要:
本研究利用SCoT标记对洞庭湖地区9个野生南荻居群的遗传多样性和遗传结构进行分析。结果表明:27条SCoT引物共扩增出429条清晰的带,其中多态性带为394条,多态性条带比率为91.39%,平均每条引物扩增多态性条数是14.60条,多态性信息含量(PIC)为0.206~0.688,平均为0.394;该地区南荻遗传多样性丰富,遗传多样性指标水平较高(PPB=91.39%、H=0.3266、I=0.4911);其野生居群具有一定程度的遗传分化(G_(st)=0.1141),遗传变异主要存在于居群内;居群间的基因流(Nm)为3.88;根据非加权配对类平均法(UPGMA)聚类分析,将南荻9个野生居群分为三类,同一流域的居群聚为一类;材料间的遗传距离与地理距离不存在相关性。
摘要(英文):
Start codon targeted polymorphism (SCoT) was used to analysis nine M.lutarioriparius populations collected from Dongting Lake to reveal the genetic diversity and genetic structure in these populations.The results showed that:(1) 27 primers were selected from 36 SCoT primers,and a total of 429 distinct bands were amplified,of which 394 (91.39%) were polymorphic,the average was 14.60 per primer.The value of locus polymorphic information contents (PIC) ranged from 0.206 to 0.688,with an average of 0.394.(2)M.lutarioriparius in Dongting Lake showed...

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