期刊论文

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西北农林科技大学学报(自然科学版)

1671-9387

2022

50

03

1-9

10.13207/j.cnki.jnwafu.2022.03.001

贵州省科技计划项目（黔科合基础[2020]1Y138）； 铜仁市科技计划项目（铜市科研[2020]80号）； 贵州省重点实验室项目（黔科合平台人才[2020]2003号）； 铜仁市科技局科技支撑计划项目（铜市科研[2020]128号）； 铜仁学院生态畜牧创新团队项目（CXTD[2020-19]）；

本校为其他机构

【目的】探究牛卵巢小黄体细胞(SLCs)和膜细胞(TCs)中的差异表达基因,进而筛选与TCs黄体化密切相关的基因,为深入研究SLCs、TCs特异性及TCs向SLCs分化的机制提供参考。【方法】利用R软件limma包中的DESeq2,筛选GEO芯片数据库GSE83524数据集TCs和SLCs中的差异表达基因,再用goseq软件对筛选出的差异表达基因进行GO功能富集分析,用kobas软件进行KEGG信号通路分析,使用String结合Cytoscape软件进行PPI网络互作分析。采集思南黄牛颗粒细胞(GCs)和TCs,以RPLP0作为内参基因,用荧光定量PCR法对筛选出的与TCs增殖及黄体化相关的基因进行验证。【结果】共筛选获得237个差异表达基因,其中表达上调的基因115...

【Objective】This study explored differentially expressed genes in small luteum cells(SLCs)and theca cells(TCs)of cattle ovary and screened genes related to TCs lutealization to provide reference for further study of SLCs,TCS specificity and TCS differentiation to SLCs.【Method】DESeq2 of limma package in R was used to screen differentially expressed genes between TCs and SLCs in the GSE83524 of GEO database.GO function enrichment was analyzed using the goseq software and the kobas software was used to perform KEGG signal pathway analysis.Prote...