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基于ITS基因分析蛇源裂头蚴种系进化关系

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成果类型:
期刊论文
作者:
靳元春;刘进辉;孔小鲜;谭磊;刘伟
作者机构:
[靳元春; 刘进辉; 孔小鲜; 谭磊; 刘伟] 湖南农业大学动物医学院, 湖南, 长沙, 410128
语种:
中文
关键词:
蛇源裂头蚴;核糖体DNA;ITS基因序列;种系进化关系
关键词(英文):
ribosomal rDNA;ITS;phylogenetic relationship
期刊:
中国预防兽医学报
ISSN:
1008-0589
年:
2018
卷:
40
期:
2
页码:
167-169
基金类别:
湖南省科技厅项目(2016NK2104) 湖南省畜牧局一般项目(20160875) 湖南省教育厅优秀青年基金项目(178126) 2016年湖南农业大学大学生创新项目(XCXl6033)
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
动物医学院
摘要:
为了研究蛇源裂头蚴种系发育关系,本研究对大王蛇裂头蚴湖南株的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)进行扩增与测序,并对其基因序列进行比对后绘制种系进化树,分析蛇源裂头蚴与其它带科绦虫的种群遗传关系.结果显示,12个蛇源裂头蚴分离株ITS基因序列长度差异较小,为1 386 bp~1 404 bp;各分离株之间ITS-1和ITS-2差异分别为0.2 %~1.3 %和0.4 %~2.2 %,与GenBank中登录的其它带科绦虫相比,同源性均分别低于66.3 %和52.1 %.表明蛇源裂头蚴ITS基因序列在种内相对保守,种间差异较大,可以作为蛇源裂头蚴的分子遗传标记.分离株系统进化树显示,所有分离株与欧猬迭宫绦虫位于同一大分支,与其他带科绦虫得到了很好的...
摘要(英文):
To explore the phylogenetic relationship of snake Sparganum, the gene sequence of internal transcribed spacers (ITS) in ribosomal DNA of snake Sparganum isolated from Hunan was amplified and sequenced. Then, ITS gene sequences alignment, and phylogenetic tree analysis were performed. The results showed that the lengths of the amplicated ITS gene sequences from the 12 snake Sparganums isolated from Hunan were 1 386 bp-1 404 bp, and the differences among the isolates were small. The differences of the corresponding gene sequences among the isol...

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