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沼气池污泥微生物总DNA提取方法的比较

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成果类型:
期刊论文
作者:
张琳;熊格生;吴莎莎;卢向阳;吴俊文;...
作者机构:
湖南农业大学 b.生物科学技术学院, 湖南 长沙
湖南农业大学 a.科学技术师范学院
湖南师范大学生命科学学院, 湖南 长沙
[刘如石; 吴俊文; 张琳; 许凤; 颜亨梅] 湖南师范大学生命科学学院, 湖南 长沙
[卢向阳; 吴莎莎] 湖南农业大学 b.生物科学技术学院, 湖南 长沙
语种:
中文
关键词:
沼气池污泥;总DNA提取;微生物多样性
关键词(英文):
PCR-DGGE
期刊:
激光生物学报
ISSN:
1007-7146
年:
2011
卷:
20
期:
6
页码:
847
基金类别:
国家自然科学基金资助项目(31072141) 中国博士后科学基金特别资助项目(201003510) 科技部国际科技合作项目(2010DFA62510) 国家“十五”科技支撑计划(2008BADC4B08) 长沙市科技计划项目(K0802157-21) 湖南省政府农办农科教科研计划项目(2008snk10)
机构署名:
本校为其他机构
院系归属:
教育学院
生物科学技术学院
摘要:
沼气发酵系统是一个复杂的生态系统,其污泥微生物超过99%是不可培养的。为了优化沼气池纤维素的转化效率、沼气的产率和开展污泥微生物多样性研究,本研究采用化学裂解法、溶菌酶裂解法和QIAampDNA Stool Mini Kit提取了沼气池污泥样品中微生物的总DNA,对三种方法的DNA得率、纯度、大片段提取效果以及是否含有PCR反应抑制剂进行了研究,最后对16S rRNA基因V3区的扩增产物进行了PCR变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)分析。与化学裂解法和QIAamp DNA Stool Mini Kit法相比,溶菌酶裂解法得到的DNA量大、片段长、片段分布广、PCR扩增效率高;同时PCR-DGGE图谱显示,溶菌酶裂解法可更好地展示沼气池污泥中微生...
摘要(英文):
Fermentation system of biogas production is a complicated ecology system, and more than 99% of the microorganisms in biogas digesters are unculturable. To optimize conditions for cellulose conversion and biogas production in biogas digesters, and also to investigate the microbial diversity in biogas digesters, Chemical lysis method, lysozyme lysis method and QIAamp DNA Stool Mini Kit were used to extract total microbe DNA of biogas digesters, and then the DNA quality, the DNA yield, the size of DNA fragments, and existence of PCR inhibitor were examined, finally PCR-DGGE profiles were carried ...

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