期刊论文

Huang, W.J.

中文

病毒学报

1000-8721

2007

23

5

345-349

10.3321/j.issn:1000-8721.2007.05.002

国家自然科学基金重大项目（编号:30599430）； 国家重点基础研究发展计划（973计划）项目（编号:2005CB523006）资助；

本校为第一机构

测定了1996～2005年间在中国分离并保存的395株H3N2亚型人流感病毒神经氨酸酶(NA)基因序列,应用生物信息学工具进行了分析.结果表明:NA基因序列的进化树表现为一主要进化主干伴随多侧分支进化,同一年份的毒株可以分为几个分支存在;疫苗株在NA基因序列进化树上存在明显的滞后现象;NA没有氨基酸的丢失与插入;抗原决定簇大部分位点保守且各抗原决定簇之间的变异情况各有特点,其中197～199位、431～434位和339～347位点的变异频率最高,而153位、328～336位、367～370位、400～403位抗原决定簇的氨基酸变异频率相对比较小;除了抗原决定簇外还有些氨基酸位点的变异频率很高,它们分别是18、23、30、93、...

The NA genes of 395 strains of human H3N2 influenza virus isolated from 1996 to 2005 in China were sequenced, analyzed with bioinformatics tools. The NA nucleotide sequence of phylogenetic tree showed a main evolution branch with multiple short side branches. The strains in the same year may be divided into several branches. There was an obvious lag between vaccine strains recommended by WHO and the Chinese circulating strains in phylogenetic tree of the NA nucleotide. The result also showed no amino acid deletion and insertion in the NA. In NA antigen sites, where including residues 197-199 a...