关联分析数据并行计算与Meta分析模型的关系探讨

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成果类型：

期刊论文

论文标题(英文)：

Relationship of Data-Parallel Computing and Meta-Analytic Model Applied to Association Studies

作者：

殷诗舒;何俊;吴晓林

作者机构：

湖南农业大学动物科学技术学院,湖南长沙410128

纽勤公司生物统计和生物信息部,内布拉斯加州林肯市68504

威斯康星大学动物科学系,威斯康星州麦迪逊市53706

[何俊; 吴晓林; 殷诗舒] 湖南农业大学

语种：

中文

关键词：

数据并行计算;Meta分析;全基因组关联分析;遗传力;群体规模

期刊：

生物数学学报

ISSN：

1001-9626

年：

2019

期：

页码：

273-281

基金类别：

(湘组2016[8]号):湖南省***计划项目

机构署名：

本校为第一机构

院系归属：

动物科学技术学院

摘要：

本研究探讨了关联分析的数据并行计算方法及其与固定效应Meta分析之间的关系,同时采用计算机模拟方法,研究了两种方法在不同的遗传力、群体规模和数据分块情形下,对估计基因效应的方差和平方偏差的影响,结果表明:(1)用并行计算和固定效应Meta分析方法所估计的基因效应具有很高的相关性(r>0.97),二者的差异主要是来源于Monte Carlo误差;(2)估计基因效应的方差和平方偏差在不同的遗传力和群体规模间的差异显著(p

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