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基于定量蛋白质组学的棉花耐涝渍基因初步鉴定

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成果类型:
期刊论文
作者:
王丽;周仲华;郑顺利;陈金湘;王峰;...
作者机构:
[王丽; 周仲华; 郑顺利; 陈金湘; 王峰; 李瑞莲; 张昊] 湖南农业大学农学院
语种:
中文
关键词:
棉花;耐涝渍;定量蛋白质组学
关键词(英文):
waterlogging tolerance;quantitative proteomics
期刊:
棉花学报
ISSN:
1002-7807
年:
2014
卷:
26
期:
4
页码:
371-376
基金类别:
国家自然科学基金(311011IO) 湖南省自然科学基金(12JJ2015) 教育部科学研究计划(2012124) 湖南省教育厅项目(118064,11C0684) 湖南农业大学人才基金(12YJl4) 湖南农业大学作物学博士点开放基金(ZWKF201309)
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
农学院
摘要:
应用iTRAQ标记结合LC-MS/MS分析的定量蛋白质组学技术,比较漂浮育苗及旱土育苗条件下棉花根系蛋白质表达差异,鉴定到169个差异表达蛋白,包括116个上调蛋白和53个下调蛋白。通过对差异表达蛋白的GO分析、COG功能注释分析以及Pathway代谢通路富集分析,发现12%的差异蛋白与棉花水分胁迫反应有关。研究还初步推测漂浮育苗棉花根系有氧呼吸受到抑制,无氧呼吸作用增强,Phosphoglucomutase、Dihydrolipoamide dehydrogenase和Alcohol dehydrogenase可能与棉花耐涝渍密切相关,其对应编码基因是棉花耐涝渍关键候选基因,值得进一步研究。
摘要(英文):
iTRAQ labeling combined with LC-MS/MS analysis quantitative proteomics techniques were employed to compare proteome of cotton seedling cultured with floating nursery or nutrient pot method in this paper. Total 169 differentially expressed proteins were identified including 116 up-regulated and 53 down-regulated proteins. GO, COG and KEGG-pathway analysis of these identified proteins reveals that 12% of them were involved in water stress response of cotton. Moreover, the research draw a previous conclusion that aerobic respiration of cotton root bred with floating nursery method is suppressed w...

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