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陆地棉ACX基因家族的鉴定与功能分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
田一波;潘奥;陈劲;周仲华;袁小玲;...
作者机构:
[潘奥; 周仲华; 田一波; 刘志; 陈劲; 袁小玲] 湖南农业大学生物科学技术学院
语种:
中文
关键词:
陆地棉;ACX基因;生物信息学;表达模式分析;病毒诱导的基因沉默
关键词(英文):
GhACX16
期刊:
棉花学报
ISSN:
1002-7807
年:
2022
卷:
34
期:
3
页码:
215-226
基金类别:
国家自然科学基金(31771847) 海南省崖州湾种子实验室揭榜挂帅项目(B21HJ2005) 湖南省农业农村厅项目(湘财建指[2022]51号和〔2021〕142号-10)。
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
生物科学技术学院
摘要:
【目的】通过对陆地棉酰基辅酶A氧化酶(acyl coenzyme A oxidase,ACX)基因家族进行鉴定和表达分析,为后续研究ACX基因的功能奠定基础。【方法】采用生物信息学方法对陆地棉基因组中ACX基因家族成员进行鉴定,并系统分析其理化性质、基因结构、进化关系、基因复制、启动子区顺式作用元件和表达模式等。利用病毒诱导的基因沉默技术初步探究GhACX16基因的功能。【结果】陆地棉基因组中鉴定到20个ACX基因,分布在13条染色体上,聚类分析将其分为4个亚族。非同义突变率/同义突变率(K_a/K_s)分析结果表明陆地棉ACX家族基因经历了较强烈的纯化选择。ACX基因的启动子区含有热应激、干旱、植物激素响应等相关...
摘要(英文):
[Objective]The acyl-coenzyme A oxidase(ACX)gene family was identified in Gossypium hirsutum and their expression patterns were analyzed,which would lay the foundation for further studies of the function of ACX genes.[Method]The members of ACX gene family in G.hirsutum genome were identified by bioinformatics method,and their physical and chemical properties,gene structure,evolutionary relationships,gene replication,cis-acting elements in promoter region and expression patterns were analyzed systematically,and the virus-induced gene silencing(VIGS)technique was used to preliminary explore the f...

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