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基于pcox1基因分析黑斑蛙小吻对盲囊线虫种系发育关系

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成果类型:
期刊论文
论文标题(英文):
PHYLOGENETIC ANALYSIS OF MITOCHONDRIAL PCOX1 GENES OF FROG CONTRACAECUM OSCULATUM
作者:
李巧燕;谭子龙;靳元春;何鑫;柳亦松;...
作者机构:
湖南省郴州市资兴市畜牧兽医水产局
[谭子龙] 易联生物科技有限公司
湖南农业大学动物医学院
[柳亦松; 靳元春; 何鑫; 刘伟] 湖南农业大学
[李巧燕] 资兴市畜牧兽医水产局
语种:
中文
关键词:
黑斑蛙;小吻对盲囊线虫;线粒体DNA;pcox1基因;种系发育关系
关键词(英文):
Contracaecum osculatum;mitochondrial DNA;pcox 1 gene;phylogenetic relationship
期刊:
中国动物传染病学报
ISSN:
1674-6422
年:
2019
卷:
27
期:
4
页码:
98-101
基金类别:
湖南省畜牧局项目资助(2139999).
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
动物医学院
摘要:
以湖南省不同地区黑斑蛙体内采集的16条小吻对盲囊线虫样品为研究对象,利用PCR对其线粒体DNA中的细胞色素c氧化酶第1亚基(cox 1)基因部分序列(pcox 1)进行扩增,分析其遗传变异情况。并利用软件Clustal X 2.0对其序列进行分析,探讨小吻对盲囊线虫与其他线虫的种群遗传关系。测序结果显示,所获得的pcox 1序列长度一致,均为400 bp,湖南省各分离株之间相应序列的相似性在97%以上,与GenBank中登录的其他小吻对盲囊线虫pcox 1序列的相似度均低于89%。结果表明,小吻对盲囊线虫pcox 1序列种内相对保守,种间差异较大,可以作为种间遗传变异研究的分子标记,从而为小吻对盲囊线虫的分子流行病学调查研究等奠...
摘要(英文):
The objectives of this study were to amplify and analyze the sequences of the mitochondrial cytochrome oxidase subunit 1 (cox 1) gene of Contracaecum osculatum samples from frogs in Hunan province and to analyze their genetic variations and population genetic relationships between frog C.osculatum and other nematode cestodes using the Clustal X 2.0.The partial sequence of cox 1 gene of frog C.osculatum was obtained and 400 bp in length.The sequence similarity was more than 97% among different isolates of Hunan province and lower than 89% as compared with the references in GenBank.The results s...

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