基于RNA-seq测序数据鉴定和分析猪基因组可变剪接事件
作者：
冉茂良;陈斌;李智;董莲花;贺长青;...
期刊：
中国科学：生命科学,2016年46(3):274-284 ISSN：1674-7232
作者机构：
[冉茂良; 陈斌; 李智; 董莲花; 贺长青; 柳小春] 湖南农业大学动物科学技术学院, 湖南省畜禽遗传改良重点实验室, 长沙, 410128
关键词：
猪;可变剪接;睾丸素
摘要：
可变剪接作为一种增加基因组和蛋白质组多样性的重要机制, 广泛发生于真核生物基因转录的过程中.本文采用Illumina Hiseq 2500测序平台对猪睾丸组织4个不同发育时期(60胚龄、90胚龄、30日龄和180日龄)进行转录组测序, 以猪基因组数据为参考, 鉴定和分析了猪基因组可变剪接事件. 从猪基因组中鉴定出20398个基因(80.6%)对应的92738个可变剪接事件.在不同的可变剪接类型中, 以第一个外显子可变剪切(alternative 5′ first exon, TSS)、最后一个外显子可变剪切(alternative 3′ last exon, TTS)、单外显子跳跃(skipped exon, SKIP)和可变5′或3′端剪切(alternative exon ends, AE) 4种类型为主,分别占所有可变剪接事件的41.0%, 32.9%, 7.6%和7.4%. GO功能富集分析显示, 发生可变剪接的基因主要富集于物质合成、物质结合及酶活性相关的GO项中, 而各发育时期特异的可变剪接基因与发育时期的生理状态密切相关, 60胚龄时主要与酶活性和组织形成相关, 30日龄时主要与抗环境应激和离子通道活性相关, 180日龄时则主要与循环系统相关. 此外,在筛选出64个与睾丸素代谢相关的基因中, 63个基因发生可变剪接, 且以TSS和TTS为主,表明这两种可变剪接类型与睾丸素合成和分泌密切相关.通过对猪基因组可变剪接的分析,为深入研究可变剪接生物学功能及进一步开展分子育种工作提供理论依据.
语种：
中文
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Systematic Identification of Long Noncoding RNAs in Immature and Mature Porcine Testes
作者：
Ran, Maoliang;Chen, Bin*;Li, Zhi;Wu, Maisheng;Liu, Xiaochun;...
期刊：
BIOLOGY OF REPRODUCTION,2016年94(4):77 ISSN：0006-3363
通讯作者：
Chen, Bin
作者机构：
[Liu, Xiaochun; He, Changqing; Ran, Maoliang; Li, Zhi; Chen, Bin] Hunan Agr Univ, Coll Anim Sci & Technol, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.;[Liu, Xiaochun; He, Changqing; Ran, Maoliang; Li, Zhi; Chen, Bin] Hunan Prov Key Lab Genet Improvement Domest Anim, Changsha, Hunan, Peoples R China.;[Zhang, Shanwen; Wu, Maisheng; Li, Zhaohui] Xiangtan Bur Anim Husb & Vet Med & Aquat Prod, Xiangtan, Peoples R China.
通讯机构：
[Chen, Bin] H;Hunan Agr Univ, Coll Anim Sci & Technol, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.
关键词：
gene expression;genomics;pig;porcine;testis
摘要：
Thousands of long noncoding RNAs (lncRNAs) have been identified in mouse, rat, and human testes, some of which play important roles in testis development and spermatogenesis. However, systematic analysis of lncRNAs expressed in postnatal pig testes has not been reported. Thus, in this study, we present the expression and characterization of lncRNAs in immature (30-day-old [D30]) and mature (180-day-old [D180]) pig testes. A total of 90 440 168 (85.75%) and 97 001 700 (95.35%) 150-base-pair paired-end clean reads were generated in D30 and D180 cDNA libraries, respectively, using the Illumina HiSeq 4000 platform; 36 727 transcripts were assembled in those two libraries, 777 lncRNA transcripts from 752 lncRNA gene loci were identified using the highly stringent pipeline, and 101 of those lncRNA transcripts were significantly differentially expressed. Those lncRNAs shared some characteristics with other mammals, including fewer exons, shorter length and exon length, and lower expression level compared with those of protein-coding genes; 402 protein-coding genes (<10 kb) were found as nearest neighbors of 294 out of 752 lncRNA genes, and gene ontology enrichment showed that they were enriched in transcription- and development-related processes. Fifteen differentially expressed and 10 novel lncRNAs were randomly selected and validated by quantitative polymerase chain reaction (PCR) and reverse transcriptase PCR. In addition, one of the 10 novel lncRNAs was further confirmed using RACE clone technology. This study provides a catalog of porcine testes lncRNAs for further understanding their regulation roles in pig testis development and spermatogenesis. © 2016 by the Society for the Study of Reproduction, Inc.
语种：
英文
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Integrated analysis of miRNA and mRNA expression profiles in development of porcine testes
作者：
Ran, Maoliang;Chen, Bin*;Wu, Maisheng;Liu, Xiaochun;He, Changqing;...
期刊：
RSC Advances,2015年5(78):63439-63449 ISSN：2046-2069
通讯作者：
Chen, Bin
作者机构：
[Liu, Xiaochun; He, Changqing; Ran, Maoliang; Li, Zhi; Yang, Anqi; Chen, Bin] Hunan Agr Univ, Coll Anim Sci & Technol, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.;[Xiang, Yongjun; Zhang, Shanwen; Wu, Maisheng; Li, Zhaohui] Xiangtan Bur Anim Husb & Vet Med & Aquat Prod, Xiangtan 411104, Peoples R China.;[Liu, Xiaochun; He, Changqing; Ran, Maoliang; Li, Zhi; Yang, Anqi; Chen, Bin] Hunan Prov Key Lab Genet Improvement Domest Anim, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.
通讯机构：
[Chen, Bin] H;Hunan Agr Univ, Coll Anim Sci & Technol, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.
摘要：
To understand the complex physiological process underlying pig testis development and spermatogenesis, this study aims to characterize the change in miRNA and mRNA profiles at four developmental stages of embryonic and postnatal testes, including 60 dpc (days post coitus, E60), 90 dpc (E90), 30-day-old (D30) and 180-day-old (D180). A total of 304 mature, 50 novel miRNAs, and 8343 differentially-expressed genes were identified. 93 (48 up and 45 down), 104 (49 up and 55 down), 122 (49 up and 73 down) differentially-expressed miRNAs, as well as 1007 (646 up and 361 down), 1929 (911 up and 1018 down), 7420 (3998 up and 3422 down) differentially-expressed genes were identified in E90 vs. E60, D30 vs. E90 and D180 vs. D30, respectively. Integrating analysis of miRNA and mRNA expression profiles predicted more than 5000 miRNA-mRNA interaction sites. GO and KEGG pathway analysis of the predicted target genes illustrated the likely roles of differentially expressed miRNAs in testis development and spermatogenesis. For example, PI3K-Akt signaling pathway and Hippo signaling pathway related development, and carbon metabolism, fatty acid metabolism, protein digestion and absorption, were involved in metabolite synthesis. These integrated high-throughput expression data show that miRNA is a critical factor in porcine testis development, providing a useful resource to understand global genome expression change in porcine testis development and spermatogenesis. ©2015 The Royal Society of Chemistry.
语种：
英文
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猪ETEC F4受体基因的筛选
作者：
柳小春;蒋隽;刘鑫;马海明;陈斌;...
作者机构：
湖南农业大学动物科学技术学院，湖南长沙 410128;湖南农业大学动物科学技术学院，湖南长沙 10128
会议名称：
第十六次全国动物遗传育种学术讨论会暨纪念吴仲贤先生诞辰100周年大会
会议时间：
2011-05-13
会议地点：
扬州
会议论文集名称：
第十六次全国动物遗传育种学术讨论会暨纪念吴仲贤先生诞辰100周年大会论文集
关键词：
猪;肠毒素大肠杆菌;F4受体;8-差异显示;基因筛选
摘要：
猪肠毒素大肠杆菌(ETEC)是仔猪腹泻的主要病原菌之一，仔猪是否腹泻，决定于仔猪肠上皮刷状缘上是否有ETEC F4受体的存在，ETEC F4受体由猪基因组上的基因所控制，开展对ETEC F4受体基因的研究，对于揭示仔猪腹泻的分子机理，培育猪抗腹泻新品种具有重要意义。
语种：
中文
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猪DECR1基因的多态性及其与肉质性状的关联分析
作者：
黄生强;柳小春;马乐;蒋隽
作者机构：
湖南农业大学，动物科学技术学院，湖南长沙 410128
会议名称：
第十六次全国动物遗传育种学术讨论会暨纪念吴仲贤先生诞辰100周年大会
会议时间：
2011-05-13
会议地点：
扬州
会议论文集名称：
第十六次全国动物遗传育种学术讨论会暨纪念吴仲贤先生诞辰100周年大会论文集
关键词：
猪DECR1基因;肉质性状;多态性
摘要：
猪线粒体2，4-双烯酰辅酶A还原酶1(DECR1)基因位于4号染色体上q12区域，它是不饱和脂肪酸进行β氧化的关键性酶，具有调节脂肪沉积的作用，可能影响猪肌内脂肪酸(IMF)含量、pH值、肉色等肉质性状。本试验拟利用现代分子生物技术，以3个外来品种(杜洛克猪、长白猪、大白猪)和5个中国地方品种(桃源黑猪、宁乡猪、沙子岭猪、大围子猪和五指山猪)为试验材料，采用PCR-SSCP和直接测序技术，筛选猪删，基因exon2，分析不同品种猪中该SNPs位点的遗传多态性及其与肉质性状的关联分析。
语种：
中文
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猪ETEC F4受体相关EST序列的RACE扩增
作者：
谢新民;柳小春;马海明;蒋隽;陈斌;...
作者机构：
湖南农业大学动物科学技术学院，湖南长沙 410128
会议名称：
第十六次全国动物遗传育种学术讨论会暨纪念吴仲贤先生诞辰100周年大会
会议时间：
2011-05-13
会议地点：
扬州
会议论文集名称：
第十六次全国动物遗传育种学术讨论会暨纪念吴仲贤先生诞辰100周年大会论文集
关键词：
猪;肠毒素大肠杆菌;模式识别受体
摘要：
猪F4型肠毒素大肠杆菌(ETEC)是仔猪泻痢的主要病原菌之一。仔猪是否泻痢，关键的一个决定因素是，仔猪肠上皮刷状缘上是否存在ETEC F4受体。ETEC F4受体由猪基因组上的基因所控制。用δ差异显示法已筛选到ETEC F4受体相关EST序列42条，其中11条EST片段在GenBank中无同源基因。本研究用5’RACE法对这些EST片段进行了扩增，以进一步了解这些EST所在基因的特性，从而揭示仔猪泻痢的分子遗传机制，为抗泻痢猪的选育奠定基础。
语种：
中文
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INHA基因多态性与猪产仔数的相关性分析
作者：
丁朝阳;陈斌;柳小春;贺长青
期刊：
中国畜牧杂志,2011年47(1):6-9 ISSN：0258-7033
作者机构：
[丁朝阳] 娄底市畜牧水产局;湖南农业大学动物科学技术学院;[柳小春; 陈斌; 贺长青] 湖南农业大学
关键词：
INHA基因;合并基因型;产仔数;猪
摘要：
研究选取抑制素a(INHA)基因为候选基因,采用PCR-RFLP和不对称PCR-SSCP技术检测其在大白猪、长白猪中的多态性,并对大白猪、长白猪不同基因型、合并基因型与猪产仔数的关系进行了分析.结果表明:INHA基因在长白、大白猪中存在外显子ⅡG262A位点突变,该位点引起Hin6 Ⅰ限制性内切酶酶切位点的改变,G等位基因为优势等位基因,GG型为优势基因型.利用不对称PCR-SSCP结合测序发现外显子ⅡA852G位点产生突变,研究表明,B为优势基因,BB为优势基因型.基因型合并分析表明,BBGG基因型为优势合并基因型,在大白猪中,总产仔数BBGG基因型要比BcGG基因型高0.7头,产活仔数BBGG基因型要比BCGG基因型高1.5头;而在长白猪中,总产仔数BBGG基因型比BCGG总产仔数高2.0头,产活仔数BBGG基因型要比BcGG基因型高1.73头.合并基因型的遗传效应并不是各基因效应的简单相加,但却要稍高于最好的单个基因型效应.
语种：
中文
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猪DECR1基因SNPs筛选及其多态性分析
作者：
黄生强;柳小春;蒋隽;马乐
期刊：
湖南农业大学学报(自然科学版),2011年37(2):192-194 ISSN：1007-1032
作者机构：
湖南农业大学动物科学技术学院,湖南长沙,410128;[柳小春; 蒋隽; 马乐; 黄生强] 湖南农业大学
关键词：
猪;单核苷酸多态性;DECR1基因;遗传多态性
摘要：
以大白猪、长白猪和杜洛克3个猪种共327头为试验材料,对2,4-dienoyl-CoA reductase 1（DECR1）基因第6至第10外显子区域进行SNPs筛选,分析SNP突变位点的遗传多态性;采用比较基因组方法,根据人DECR1基因全长序列设计引物,筛选猪DECR1基因的SNP,经PCR-SSCP技术和测序检测,发现Exon6和Exon8区域各存在1个SNP突变位点（C/T,C/G）,但Exon6区域的SNP突变是无义突变,而Exon8的是错义突变;在对Exon8 SNP的遗传结构分析中,3个猪种中均检测到CC、CG、GG 3种基因型,说明猪群在该位点均具有丰富的遗传多态性。
语种：
中文
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新美系猪的生长肥育和肉用性状分析
作者：
何俊;贺长青;刘正祥;周森林;柳小春
期刊：
湖南农业大学学报(自然科学版),2011年37(2):195-198 ISSN：1007-1032
作者机构：
湖南农业大学动物科学技术学院,湖南长沙,410128;湖南新五丰股份有限公司湘潭原种猪场,湖南湘潭,411228;[柳小春; 何俊; 贺长青] 湖南农业大学;[刘正祥; 周森林] 湖南新五丰股份有限公司
关键词：
猪;生长肥育;胴体品质;肉用性能;杂交组合
摘要：
试验在湖南新五丰股份有限公司湘潭原种猪场进行,共设杜洛克（D）、长白（L）、大白（Y）猪和长×大（LY）、大×长（YL）、杜×长大（DLY）6个组,每组选取健康、体重25 kg左右的猪12头,公母各半,饲养至组平均体重约100 kg时,每组选取4头（公母各半）进行屠宰测定和肉质分析。结果表明,美系猪选育群各品种猪的日增重达830 g以上,料肉比2.53以下,瘦肉率高达67.61%~71.79%;DLY组猪生长最快,平均日增重达977 g,料肉比为2.34。屠宰和肉质性状间呈显著相关关系,料肉比与皮厚、料肉比与pH值（背）、背膘厚与脂率、皮厚与pH值（背）呈正相关,指标间的相关系数分别为0.949 3、0.960 4、0.927 3和0.983 6;后腿比例与贮存损失间呈极显著负相关,相关系数为-0.951 8。对DLY商品猪背最长肌肉样的氨基酸分析表明,鲜味氨基酸和必需氨基酸的含量分别为77.94、44.13 mg/g。
语种：
中文
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小肠组织中ATP2B1基因的荧光定量PCR分析
作者：
何俊;柳小春;蒋隽;贺长青;黄生强;...
作者机构：
[何俊; 柳小春; 蒋隽; 贺长青; 黄生强; 马海明] 湖南农业大学动物科学技术学院
会议名称：
第十二次全国畜禽遗传标记研讨会
会议时间：
2010-10-14
会议地点：
南京
会议论文集名称：
第十二次全国畜禽遗传标记研讨会论文集
关键词：
仔猪腹泻;小肠组织;荧光定量;候选基因
摘要：
<正>引言ATP酶钙离子转运质膜1基因(ATP2B1,ATPase Ca2+ transporting plasma membrane 1)调控肠道细胞的Na+和Ca2+平衡。因为仔猪腹泻是由于大肠杆菌释放的毒素使水和电解液大量流入肠内,从而引起特征性的临床症状。而小肠上皮细胞含有钙结合蛋白和Ca2+-ATPase,这对仔猪腹泻的研究有着重要意义。采用实时荧光PCR方法在小肠组
语种：
中文
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番鸭体重生长非线性混合效应模型评价的研究
作者：
张元跃;柳小春
期刊：
中国农业科学,2010年43(19):4101-4108 ISSN：0578-1752
作者机构：
[张元跃; 柳小春] 湖南农业大学动物科学技术学院
关键词：
非线性混合效应模型;体重;番鸭;评价
摘要：
【目的】定量描述和估计本地番鸭体重生长的轨迹和参数。【方法】本研究对116只番鸭进行了21weeks的饲养和观测;利用5种生长函数(Gompertz、Logistic、VonBertalanffy、Richards和Brody)拟合了番鸭体重生长的非线性混合效应模型;分别计算了这些模型的8个生长参数(成熟体重、拐点日龄、拐点体重、初生体重、绝对生长率、相对生长率、绝对成熟率和相对成熟率);根据信息准则、误差方差的大小和生长参数估计值的准确度,比较了不同模型间的拟合和估计结果。【结果】与非线性固定效应模型比较,5种非线性混合效应模型拟合的番鸭体重生长方程和估计的8个生长参数,其准确度整体上提高了许多;全群番鸭体重生长Gompertz非线性混合效应模型,其信息准则最小,误差方差减少量达99.92%;雄、雌番鸭体重生长Richards非线性混合效应模型,其信息准则最小,误差方差减少量分别是89.80%、91.81%。【结论】Gompertz和Richards非线性混合效应模型分别是评价全群和雄、雌番鸭体重生长的最优模型。
语种：
中文
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猪肠毒素大肠杆菌'F4受体的微卫星标记筛选
作者：
蒋隽;刘小兰;马海明;柳小春;何俊;...
期刊：
湖南农业大学学报(自然科学版),2010年36(3):321-325 ISSN：1007-1032
作者机构：
华南农业大学,动物科学学院,广东,广州,510642;湖南农业大学,动物科学技术学院,湖南,长沙,410128;湖南省洞口县成人中等专业学校,湖南,邵阳,422300
关键词：
肠毒素大肠杆菌;微卫星座位;基因频率;遗传差异;猪
摘要：
从猪13号染色体选取与肠毒素大肠杆菌（ETEC）F4受体基因连锁的8个微卫星座位,研究不同猪种间的遗传特性,并分析不同基因型与F4受体黏附表型的关系.结果表明,2个地方猪种（五指山猪和沙子岭猪）和2个外来猪种（大约克猪和杜洛克猪）在8个基因座均具有高度多态性,杂合度为0.6117～0.7500,多态信息含量在0.5749以上.对大约克猪和沙子岭猪的F4黏附性和微卫星的关联研究表明,在微卫星座位S0223和SW207,2个猪种不同基因型在F4ab和F4ac血清型黏附表型上差异显著或极显著,可能F4ab和F4ac受体就位于这2个位点之间.这2个微卫星座位可望作为ETECF4抗性基因的遗传标记.
语种：
中文
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猪肉pHI和pHU相关SNP-QTL检测
作者：
蒋隽;马海明;柳小春;黄生强;何俊;...
期刊：
湖南农业大学学报(自然科学版),2010年36(2):203-205 ISSN：1007-1032
作者机构：
[蒋隽] 华南农业大学,动物科学学院,广东,广州,510642;[蒋隽] 湖南农业大学,动物科学技术学院,湖南,长沙,410128;[柳小春; 马海明; 何俊; 黄生强] 湖南农业大学;[张细权] 华南农业大学
关键词：
猪肉;pH值;单核甘酸多态性;数量性状位点
摘要：
以1个丹麦家猪家系为试验材料,对猪全基因组单核苷酸多态性(SNP)标记筛选与猪肉pHI 和pHU值有关的QTL.结果发现在6号染色体上存在一个显著影响pHI 和pHU值的QTL,与pHI显著相关的QTL的效应为2.6%~8.5%,其中单倍型FLJ30670的贡献率最高,为8.5%,与pHU显著相关的QTL中效应为2.1%~4.3%,都低于pHI有关的效应,其中效应最大的单倍型为FUT1,贡献率为4.3%,估计是猪肉24 h酸度变化受外界其他因素的影响更多.
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钙蛋白酶抑制蛋白(CAST)基因型与营养水平互作对猪胴体性状的影响
作者：
彭英林;柳小春;施启顺;杨仕柳;朱吉;...
期刊：
南方,2009年17(5):767-772 ISSN：1006-1304
作者机构：
[彭英林] 湖南农业大学,动物科技学院;[柳小春; 施启顺] 湖南农业大学动物科学技术学院;[杨仕柳; 朱吉; 左剑波] 湖南省畜牧兽医研究所
关键词：
猪;基因型与营养互作;胴体性状;钙蛋白酶抑制蛋白基因(CAST)
摘要：
钙蛋白酶抑制蛋白(calpastatin,CAST)对肌内蛋白降解、肌细胞生长速度以及屠宰后钙蛋白酶的活性具有重要的影响,研究CAST基因多态性的遗传效应及其与营养水平的互作影响对猪胴体品质的控制具有重要的作用.实验使用杜洛克和大围子2个纯种猪群,杜洛克×(长白×大白)和大白×大围子2个杂种猪群,利用Hinf Ⅰ,Msp Ⅰ和Rsa Ⅰ 3种内切酶研究了CAST基因的RFLP及其与营养水平互作对猪胴体性状的影响.结果表明,Hinf Ⅰ、Msp Ⅰ和Rsa Ⅰ 3种内切酶在4个猪群均获得RFLP,酶切位点分别存在1对等位基因A与B,C与D及E与F.AA基因型×高营养水平互作显著降低熟肉率和滴水损失.但与中营养水平互作却显著提高滴水损失(P<0.05). AB基因型×高营养水平互作显著降低胴体长和眼肌面积,提高肌肉的滴水损失;但AB基因型×中营养水平互作则显著降低屠宰率、背膘厚和熟肉率,并提高腿臀比例和瘦肉率(P<0.05).CD基因型×高营养水平互作对所有性状的瓦作效应显著,CC基因型×中营养水平组提高滴水损失(P(0.05). EF基因型×高营养水平互作能对多个性状产生达到或超过群体均数的10%的效应(P<0.05),EE基因型×中营养水平互作显著增加背膘厚.
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猪ADIPOR1和CTSF基因对生长及胴体性状遗传效应的分析
作者：
柳小春;黄冬维;张元跃;马海明
作者机构：
[柳小春; 黄冬维; 张元跃; 马海明] 湖南农业大学动物科技学院
会议名称：
第十五次全国动物遗传育种学术讨论会
会议时间：
2009-10-10
会议地点：
陕西杨凌
会议论文集名称：
第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集
关键词：
猪;生长性状;胴体性状
摘要：
<正>引言脂联素受体1(Adiponetin receptor 1,ADIPOR1)介导脂肪因子脂联素作用于动物骨骼肌和脂肪细胞等全身广泛组织,从而影响动物的生长、脂肪沉积等性状表现,同时该基因与日增重,背膘厚以及胴体重的QTL
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利用杂种细胞克隆板将猪CDC16基因染色体定位于SSC11
作者：
马海明;柳小春;贺长青;蒋隽;何俊;...
作者机构：
[马海明; 柳小春; 贺长青; 蒋隽; 何俊; 黄生强] 湖南农业大学动物科技学院
会议名称：
第十五次全国动物遗传育种学术讨论会
会议时间：
2009-10-10
会议地点：
陕西杨凌
会议论文集名称：
第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集
关键词：
猪;放射杂交板;物理定位;CDC16基因
摘要：
<正>引言分裂后期刺激复合体(The Anaphase-Promoting complex,APC)是一种泛素的配体,是细胞有丝分裂中细胞周期素降解系统中的细胞周期调节的组成成分之一,而细胞周期素控制整个有丝分裂的过程。脊椎动物
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猪INHA与GnRHR基因型互作效应对产仔数的影响
作者：
丁朝阳;陈斌;柳小春;贺长青
期刊：
湖南农业大学学报(自然科学版),2009年35(5):509-513 ISSN：1007-1032
作者机构：
[丁朝阳; 陈斌; 柳小春; 贺长青] 湖南农业大学,动物科学技术学院
关键词：
猪;INHA基因;GnRHR基因;产仔数;互作效应
摘要：
利用不对称PCR-SSCP、PCR-SSCP、PCR-RFLP技术检测了INHA基因、GnRHR基因在大白猪、长白猪、宁乡猪、桃源猪、大围子猪、沙子岭猪、海南五指山猪中的多态性.结果表明,INHA基因外显子Ⅱ检测到2个突变位点,即外显子ⅡG262A位点和A852G位点.在GnRHR基因5(-UTR端310 bp处有1个A→C的突变位点.分析INHA基因G262A与GnRHR基因A310C互作效应时发现,基因型的互作效应在大白猪中极显著(P<0.01),在长白猪中达到了显著水平(P<0.05).基因互作型效应最大的是AGDD基因互作型,最小的是GGEE基因互作型.分析INHA基因A852G与GnRHR基因A310C互作效应时发现,各基因型互作对总产仔数、产活仔数影响不显著(P﹥0.05).
语种：
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INHA基因多态性与母猪产仔性能的相关性研究
作者：
丁朝阳;陈斌;柳小春;贺长青;邓永扬;...
作者机构：
[丁朝阳; 陈斌; 柳小春; 贺长青; 邓永扬; 贺赛美] 湖南农业大学动物科学技术学院;[丁朝阳; 陈斌; 柳小春; 贺长青; 邓永扬; 贺赛美] 正虹原种猪场
会议名称：
第十五次全国动物遗传育种学术讨论会
会议时间：
2009-10-10
会议地点：
陕西杨凌
会议论文集名称：
第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集
关键词：
猪;INHA基因;多态性;产仔数
摘要：
<正>引言抑制素是由睾丸支持细胞和卵巢颗粒细胞分泌的糖蛋白激素,有α-、β-两个亚基组成的异二聚体,通过FSH分泌调节哺乳动物的产仔性能。国内外很多学者对不同品种的绵羊、山羊、小尾寒羊的抑制素α亚基基
语种：
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δ差异显示法筛选仔猪ETEC F4ad受体相关基因
作者：
蒋隽;施启顺;刘鑫;马海明;贺长青;...
期刊：
畜牧兽医学报,2009年40(6):939-943 ISSN：0366-6964
作者机构：
[蒋隽; 施启顺; 柳小春; 马海明; 贺长青; 刘鑫] 湖南农业大学动物科学技术学院
关键词：
肠毒素大肠杆菌;F4ad受体;δ差异显示;糖基磷脂酰肌醇锚1;仔猪
摘要：
初生仔猪泻痢的病原菌主要是肠毒素大肠杆菌(ETEC)F4,仔猪小肠上皮细胞有无F4受体对于仔猪抗病性具有重要意义.本试验采用δ差异显示法筛选仔猪F4ad受体相关基因.将获得的δ条ESTs通过GenBank进行序列同源比对,发现其中1条与人糖基磷脂酰肌醇锚1(GPI 1)基因有91%同源性.表明该基因可作为F4ad受体候选基因进行进一步研究.
语种：
中文
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猪生长及胴体性状3个相关基因座遗传效应
作者：
柳小春;肖调义;何伟光;马海明;刘鑫;...
期刊：
中国农业科学,2009年42(2):742-747 ISSN：0578-1752
作者机构：
[柳小春; 肖调义; 何伟光; 马海明; 刘鑫; 刘峰; 何俊] 湖南农业大学动物科学技术学院
关键词：
猪;生长性状;胴体性状
摘要：
[目的]研究猪生长性状相关基因多态性,各多态位点对猪生长及胴体性状的影响,为分子标记辅助选择提供依据.[方法]采用PCR-RFLP方法分析PIT1、HDAC1,IGF2基因在不同品种酶切位点多态性,分析不同基因型对生长与胴体性状的遗传效应.[结果]PIT1基因C等位基因、HDAC1基因G等位基因、IGF2基因A等位基因均有显著提高生长的效应,达100 kg活重所需时间一般可缩短6～9 d.PIT1基因C等位基因、HDAC1基因G等位基因、IGF2基因A等位基因提高瘦肉率3～5个百分点、背膘厚降低2～3 mm,生长性能指数得到相应提高.[结论]上述基因的有利等位基因有可能在选种中作为分子标记.
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