不同处置条件对稻瘟病菌致病力的影响
作者：
谭阳;黎玲;石银丰;陈小林;彭志荣;...
期刊：
杂交水稻 ,2020年35(04):92-95 ISSN：1005-3956
作者机构：
湖南农业大学农学院, 湖南, 长沙, 410128;湖南大学研究生院隆平分院, 湖南, 长沙, 410125;湖南杂交水稻研究中心, 杂交水稻国家重点实验室, 湖南, 长沙, 410125;华中农业大学植物科技学院, 湖北, 武汉, 430070;杂交水稻国家重点实验室,,湖南杂交水稻研究中心, 杂交水稻国家重点实验室
关键词：
稻瘟病菌;致病力;温度;pH值;灭活
摘要：
通过选取属于不同生理小种的6个稻瘟病菌株研究pH值变化、高温处理、放置温度及放置时间等不同处置条件对其致病力的影响。结果表明,菌株孢子悬浮液pH值升高或降低都可以导致菌株致病力减弱,但pH值升高更有效;大部分稻瘟病菌株孢子悬浮液在4℃放置20 d以上或20℃放置10 d以上致病力均丧失,而菌株P131孢子悬浮液4℃或20℃放置20d仍具有致病能力;大部分菌株在煮沸30min后即丧失致病能力,但菌株HN52与P131在煮沸1h后虽然致病力下降,但仍保持有致病能力,而用灭菌锅在121℃下处理20 min后所有菌株致病力均完全丧失。因此,灭菌锅高温灭菌是灭活稻瘟病菌最直接有效的方式。
语种：
中文
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水稻稻瘟病抗性基因Pik-2的遗传变异及进化分析
作者：
牛玉芳;肖贵;吴俊;柏斌;周波;...
期刊：
生物学杂志 ,2020年37(3):21-25 ISSN：2095-1736
作者机构：
湖南农业大学农学院;[吴俊; 周波; 肖贵; 柏斌] 杂交水稻国家重点实验室湖南省杂交水稻研究中心;国际水稻研究所;[肖应辉; 牛玉芳] 湖南农业大学
关键词：
非洲稻;亚洲稻;稻瘟病;抗病基因
摘要：
Pik位点是水稻第11染色体上稻瘟病抗性基因成簇分布的热点区域,对该位点抗性基因在水稻品种中多样性分布的研究,有助于揭示该基因的进化规律和进一步挖掘其等位基因。对来自不同国家和地区的400份非洲稻和400份亚洲稻稻种抗稻瘟病基因Pik-2编码区序列进行了测序分析,发现非洲稻和亚洲稻品种Pik-2编码区碱基变异非常丰富,非洲稻种中出现了113个变异位点,亚洲稻种中有78个碱基位点发生多样性变异,其中两者均在1879位点显示出极高的变异频率;根据其碱基变异特点,非洲稻种和亚洲稻种分别呈现出17和12种单倍型。单倍型的地区分布研究显示,非洲稻的分布呈现出大聚集、小分散的特点,而亚洲稻的分布来源就显得非常广泛。不同单倍型的系统进化分析表明,大多类群中同时包含非洲稻与亚洲稻的单倍型,暗示非洲稻与亚洲稻在相互独立的进化过程中在Pik-2 LRR结构域各自形成了相似的单倍型。
语种：
中文
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广谱抗稻瘟病种质75-1-127的褐飞虱抗性基因鉴定及分子标记辅助选择育种
作者：
降好宇;曾盖;郝明;黄湘桂;肖应辉
期刊：
中国水稻科学 ,2019年33(3):227-234 ISSN：1001-7216
通讯作者：
Xiao, Y.
作者机构：
[郝明; 黄湘桂; 降好宇; Zeng G.; 肖应辉] Agronomy College, Hunan Agricultural University, Hunan Provincial Key Laboratory of Rice and Rapeseed Breeding for Disease Resistance, Southern Regional Collaborative Innovation Center for Grain and Oil Crops in China, Changsha, 410128, China
通讯机构：
[Xiao, Y.] A;Agronomy College, Hunan Agricultural University, Hunan Provincial Key Laboratory of Rice and Rapeseed Breeding for Disease Resistance, Southern Regional Collaborative Innovation Center for Grain and Oil Crops in China, Changsha, China
关键词：
水稻;褐飞虱抗性;分子标记辅助育种
摘要：
【目的】水稻品系75-1-127携带广谱抗稻瘟病基因Pi9,已被广泛应用于抗稻瘟病水稻品种改良。笔者育种实践发现75-1-127表现出较强的褐飞虱抗性,因此鉴定该品系中的褐飞虱抗性基因并进行分子辅助选择育种。【方法】根据水稻品系B5中褐飞虱抗性基因Bph14和Bph15的序列,设计引物扩增75-1-127的基因组DNA,并对PCR产物进行测序分析。采用苗期集团法鉴定了75-1-127和B5的褐飞虱抗性表型。利用与Bph14与Bph15连锁的分子标记筛查了75-1-127为稻瘟病抗源回交转育的两系不育系后代,并鉴定了这些后代的稻瘟病抗性、褐飞虱抗性和主要农艺性状。【结果】75-1-127中含有与B5完全一致的Bph14和Bph15序列。75-1-127和B5苗期褐飞虱抗性均为1级。在以75-1-127为抗源改良的两系不育系中,携带Bph14、Bph15的单基因系或双基因系的褐飞虱抗性均得以改良,其中双基因聚合系的死苗率为8.5%,与供体亲本75-1-127以及阳性对照B5差异不显著,进一步证实75-1-127含有褐飞虱抗性基因。【结论】水稻品系75-1-127携带褐飞虱抗性基因Bph14和Bph15,可以作为抗源应用于水稻褐飞虱抗性育种。
语种：
中文
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分子标记辅助选择改良水稻两用核不育系创5S稻瘟病抗性和镉积累特性研究
作者：
黄湘桂;降好宇;张菊萍;唐伟;肖应辉
期刊：
杂交水稻 ,2019年34(4):51-56 ISSN：1005-3956
作者机构：
湖南农业大学农学院, 湖南, 长沙, 410128;水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室, 水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室, 湖南, 长沙, 410128;南方粮油作物协同创新中心, 南方粮油作物协同创新中心, 湖南, 长沙, 410128;[黄湘桂; 降好宇; 肖应辉] 湖南农业大学农学院, 湖南, 长沙, 410128 水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室, 水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室, 湖南, 长沙, 410128 南方粮油作物协同创新中心, 南方粮油作物协同创新中心, 湖南, 长沙, 410128;[张菊萍; 唐伟] 湖南农业大学农学院, 湖南, 长沙, 410128
关键词：
水稻;抗稻瘟病;镉低积累;分子标记辅助选择;基因聚合
摘要：
为了培育抗稻瘟病且籽粒镉低积累的水稻两用核不育系,利用谷梅4号、天津野生稻和魔王谷为稻瘟病抗源, Cd14030(日本晴的衍生系)为稻米镉低积累基因OsHMA3的供体亲本,采用分子标记辅助选择技术和逐步聚合的方法,创制了基于创5S(C5S)背景的包含抗病双基因和镉低积累基因的三基因聚合系。三基因聚合系的苗瘟感病级别为1.5~2.1级,与抗病双基因聚合系无显著差异,但三基因聚合改良株系的糙米镉含量因亲本来源而异,其中,基因型为C5S(Pi49+Pigm+OsHMA3)的改良系糙米镉含量为0.051~0.067 mg/kg,与日本晴(0.051 mg/kg)相当,较C5S(0.118 mg/kg)下降43.2%~56.8%,较好地将稻瘟病抗性与镉低积累特性聚合于两用核不育系创5S中。此外,三基因聚合改良株系的主要农艺性状大多与C5S相近,其中有一些株系甚至在每穗总粒数与一次枝梗数上还得到了改良。
语种：
中文
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水稻三结构域多铜氧化酶基因家族生物信息学分析 <&wdkj&>Bioinformatics Analysis on the Gene Family of Three-domain Multi-copper Oxidases in Rice
作者：
王有成;谭炎宁;张超;殷小林;何强;...
期刊：
分子植物育种 ,2019年17(5):1385-1392 ISSN：1672-416X
作者机构：
湖南农业大学农学院;[谭炎宁; 张超; 何强] 湖南杂交水稻研究中心;湖南大学研究生院隆平分院;[肖应辉; 邓华凤; 王有成] 湖南农业大学;[殷小林] 湖南大学
关键词：
水稻;多铜氧化酶;基因家族;结构域;生物信息学分析
摘要：
三结构域多铜氧化酶是生物体内非常重要的金属氧化酶,对机体生长和发育具有重要影响。为了系统地了解水稻三结构域多铜氧化酶基因家族的基本情况,本研究运用生物信息学方法对其成员进行了预测和分析;研究发现,以拟南芥三结构域多铜氧化酶基因At5g21105为靶序列,利用BlastP为工具在水稻基因组中共搜索到38个同源基因;这些基因的蛋白产物都依次含有Cu-oxidase3、Cu-oxidase和Cu-oxidase2三种结构域,各结构域中含有铜离子结合位点,二级结构具有α-螺旋和β-转角等基本特征,特推断它们都属于三结构域多铜氧化酶家族成员;进一步地,根据同源性程度将水稻多铜氧化酶基因家族成员划分为ClassⅠ和ClassⅡ两个亚家族,其中ClassⅠ包含31个基因,ClassⅡ包含7个基因。这些研究结果为进一步研究水稻多铜氧化酶基因家族成员的功能提供了参考依据。
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中文
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Genome-wide association mapping of resistance against rice blast strains in South China and identification of a new Pik allele
作者：
Li, Chenggang;Wang, Dan;Peng, Shasha;Chen, Yue;Su, Pin;...
期刊：
Rice ,2019年12(1):1-9 ISSN：1939-8425
通讯作者：
Zhang, Deyong;Liu, Yong;Wang, Guo-Liang
作者机构：
[Chen, Yue; Li, Chenggang; Tan, Xinqiu; Chen, Jianbin; Zheng, Limin; Su, Pin; Zhang, Deyong; Liu, Yong] Hunan Acad Agr Sci, State Key Lab Hybrid Rice, Changsha 410125, Hunan, Peoples R China.;[Chen, Yue; Li, Chenggang; Tan, Xinqiu; Chen, Jianbin; Zheng, Limin; Su, Pin; Zhang, Deyong; Liu, Yong] Hunan Acad Agr Sci, Inst Plant Protect, Changsha 410125, Hunan, Peoples R China.;[Wang, Dan; Xiao, Yinghui; Wang, Guo-Liang; Liu, Jinling; Peng, Shasha] Hunan Agr Univ, Southern Reg Collaborat Innovat Ctr Grain & Oil C, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.;[Wang, Dan; Xiao, Yinghui; Wang, Guo-Liang; Liu, Jinling; Peng, Shasha] Hunan Agr Univ, Coll Agron, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.;[Kang, Houxiang] Chinese Acad Agr Sci, Inst Plant Protect, Beijing 100193, Peoples R China.
通讯机构：
[Zhang, DY; Liu, Y; Wang, Guo-Liang] H;[Wang, Guo-Liang] O;Hunan Acad Agr Sci, State Key Lab Hybrid Rice, Changsha 410125, Hunan, Peoples R China.;Hunan Acad Agr Sci, Inst Plant Protect, Changsha 410125, Hunan, Peoples R China.;Hunan Agr Univ, Southern Reg Collaborat Innovat Ctr Grain & Oil C, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.
关键词：
GWAS;Rice blast;QTL;R gene;Pikx
摘要：
Effective management of rice blast, caused by the fungus Magnaporthe oryzae, requires an understanding of the genetic architecture of the resistance to the disease in rice. Rice resistance varies with M. oryzae strains, and many quantitative trait loci (QTLs) affecting rice blast resistance have been mapped using different strains of M. oryzae from different areas. However, little is known about the genetic architecture of rice resistance against the M. oryzae population in Hunan Province, which is a main rice production area in South China. In this study, we used three isolates from Hunan Province and the rice diversity panel 1 to perform a genome-wide association study (GWAS) of blast resistance in rice. A total of 56 QTLs were identified. One of the QTLs is localized with the resistance gene Pik locus which confers resistance to all three isolates. Genomic sequence analysis of the resistant cultivars led to the identification of a new Pik allele, which we named Pikx. Yeast two-hybrid and co-immunoprecipitation assays between AvrPiks and Pikx confirmed that Pikx is a new allele at the Pik locus. Our GWAS has identified many new blast resistance QTLs. The identified new Pik allele Pikx will be useful for breeding cultivars with high resistance to blast in Hunan and other South China provinces. Further research on the relationship between AvrPiks and Pikx will provide new insights into the molecular mechanism of rice resistance to M. oryzae.
语种：
英文
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广谱抗稻瘟病基因Pi9的共显性功能标记的开发与利用
作者：
李永聪;匡博文;周小龙;刘芝妤;林晋军;...
期刊：
分子植物育种 ,2019年17(16):5342-5346 ISSN：1672-416X
作者机构：
湖南农业大学农学院,国家南方粮油作物协同创新中心,作物基因工程和水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室,长沙,410128;[刘金灵; 林晋军; 李永聪; 肖应辉; 刘芝妤; 刘雄伦; 周小龙; 匡博文] 湖南农业大学
关键词：
水稻(Oryza sativa);稻瘟病;共显性功能
摘要：
稻瘟病是水稻最严重的真菌病害之一。利用抗病基因培育抗病品种是防治稻瘟病最有效的策略。抗稻瘟病基因Pi9是第一个克隆的广谱抗稻瘟病基因,对世界多个国家和地区的稻瘟菌小种都表现高水平抗性,有着重要的应用价值。为了针对拟改良的不同遗传背景的水稻材料,开发Pi9基因特异性功能分子标记,用于分子标记辅助选择育种,本研究开发设计了1个新的Pi9基因共显性功能分子标记。通过对23份育种核心材料的多态性检测和育种改良杂交F1代、BC6F2代群体的鉴定,表明该分子标记能有效的对Pi9功能基因进行鉴定,并对回交育种后代进行高效选择,为培育Pi9基因抗病品种提供了新的分子标记辅助选择技术。
语种：
中文
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水稻抗稻瘟病基因Pi47的精细定位和候选基因分析
作者：
肖湘谊;史学涛;盛浩闻;刘金灵;肖应辉
期刊：
作物学报 ,2018年44(7):977-987 ISSN：0496-3490
通讯作者：
Xiao, Y.-H.
作者机构：
[肖湘谊; 史学涛; 盛浩闻; 刘金灵; 肖应辉] 湖南农业大学农学院, 水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室;[肖湘谊; 史学涛; 盛浩闻; 刘金灵; 肖应辉] 南方粮油作物协同创新中心, 湖南, 长沙, 410128
通讯机构：
[Xiao, Y.-H.] A;Agronomy College of Hunan Agricultural University / Hunan Provincial Key Laboratory of Rice and Rapeseed Breeding for Disease Resistance / Southern Regional Collaborative Innovation Center for Grain and Oil Crops in ChinaChina
关键词：
水稻;稻瘟病;抗病基因;精细定位
摘要：
不断挖掘和克隆抗稻瘟病新基因,是解析水稻抗病分子遗传机制和培育抗稻瘟病新品种的重要基础。Pi47是笔者从广谱、持久抗稻瘟病湖南地方品种湘资3150中鉴定的稻瘟病抗性基因,前期研究将其初步定位于第11染色体标记RM224和RM5926间。本研究利用3个Pi47单基因系与感病亲本CO39杂交F_2群体1687个感病单株对 Pi47精细定位,利用6个STS标记对3个单基因系进行背景分析,采用生物信息学方法进行了候选基因分析。结果表明, Pi47被精细定位于CAPS标记S32与K33间0.24 cM区域的171.2 kb物理区间内,背景分析将Pi47进一步缩小至SC12和K33间67.8 kb的区间内;该区间含有8个结构基因,其中2个编码NBS-LRR抗病类似蛋白,为Pi47的候选功能基因。稻瘟菌抗谱比较分析发现, Pi47单基因系与其定位区间内4个Pik位点的等位基因Pik、Pikm、Pikh和Pikp的近等基因系抗谱不同。这些结果为进一步克隆Pi47和利用其进行分子标记辅助选择培育抗稻瘟病水稻新品种奠定了基础。
语种：
中文
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Mapping of quantitative trait loci associated with concentrations of five trace metal elements in rice (Oryza sativa)
作者：
Huang, Fenglin;Wei, Xiangjin;He, Jiwai;Sheng, Zhonghua;Shao, Gaoneng;...
期刊：
International Journal of Agriculture and Biology ,2018年20(3):554-560 ISSN：1560-8530
通讯作者：
Hu, Peisong
作者机构：
[Huang, Fenglin; Xiao, Yinghui; He, Jiwai; Wang, Jianlong; Hu, Peisong] Hunan Agr Univ, Coll Agron, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.;[Huang, Fenglin; Shao, Gaoneng; Wei, Xiangjin; He, Jiwai; Sheng, Zhonghua; Tang, Shaoqing; Hu, Peisong] China Natl Rice Res Inst, State Key Lab Rice Biol, Hangzhou 310006, Zhejiang, Peoples R China.;[Huang, Fenglin; Xia, Shengpin] Hunan Acad Agr Sci, Hunan Rice Res Inst, Changsha 410125, Hunan, Peoples R China.
通讯机构：
[Hu, Peisong] H;[Hu, Peisong] C;Hunan Agr Univ, Coll Agron, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.;China Natl Rice Res Inst, State Key Lab Rice Biol, Hangzhou 310006, Zhejiang, Peoples R China.
关键词：
Mapping;QTLs;Recombinant inbred lines;Rice;Trace metal element concentrations
摘要：
Trace metal element concentrations in rice (Oryza sativa L.) have great effects on the health of human being. In this study, QTLs for the concentrations of Cd, Cu, Fe, Mn and Zn in brown rice were identified using a recombinant inbred lines (RIL) population. A total of 22 QTLs for the concentrations of Cd, Cu, Fe, Mn and Zn in brown rice were identified with 204 recombinant inbred lines (RILs), including qCd5 for pot cultivation (PC) with Cd stress and paddy field cultivation (FC) trials in Hangzhou, 9 for PC trial only, and 13 for FC trial only. The phenotypic variance explained by a single QTL ranged as 4.6-9.9% and 2.8-10.4% in PC and FC trials, respectively. Among all QTLs, qCu4-2 had the largest single effect (10.4% of the phenotypic variance), qCu7 had the lowest single effect (2.8% of the phenotypic variance). The positive alleles (increasing trace metal element concentrations) at 16 QTLs except qCd2, qCu7, qFe7, qMn7, qZn1-1 and qZn4 were inherited from the female parent Zhenshan 97 B (ZS97B). These QTLs distributed on chromosomes 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10 and 11. Six QTLs were clustered in 1, 4 and 7 chromosomal regions. Especially, qCd5 was a novel QTL regulated low Cd accumulation in rice. The identification of QTLs provides good candidates for fine mapping and cloning, and could be utilized to improve rice safe and nutritional quality by MAS. © 2018 Friends Science Publishers.
语种：
英文
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MAS聚合Pi9和Pi49位点改良水稻两系不育系创5S稻瘟病抗性
作者：
张菊萍;郝明;曾盖;曹志;降好宇;...
期刊：
分子植物育种 ,2018年16(22):7372-7379 ISSN：1672-416X
作者机构：
[张菊萍; 郝明; 曾盖; 曹志; 降好宇; 黄湘桂; 肖应辉] 湖南农业大学农学院, 水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室;[张菊萍; 郝明; 曾盖; 曹志; 降好宇; 黄湘桂; 肖应辉] 南方粮油作物协同创新中心, 长沙, 410128
关键词：
水稻;两系不育系;稻瘟病;分子标记辅助选择;基因聚合
摘要：
为了改良水稻两系不育系创5S的稻瘟病抗性,分别以携带稻瘟病抗性基因Pi9位点（Pi9/Pigm/Pi2-1）的75-1-127、谷梅4号和天津野生稻以及携带Pi49位点的魔王谷为基因供体,通过回交转育和分子标记辅助选择技术,育成了包含单一抗性位点的创5S抗病单基因系;在此基础上,采用聚合杂交和分子标记辅助选择技术,培育了包含两个抗性位点的创5S抗病双基因聚合改良系。结果表明：携带单一抗性位点的改良不育系稻瘟病抗性显著增强,苗期发病级数显著低于受体亲本创5S;聚合2个抗性位点的改良系,较携带单一抗性位点的不育系稻瘟病抗性进一步增强、抗谱拓宽;部分改良不育系的株高、穗长、有效穗数、每穗总粒数、柱头外露率等农艺性状与创5S有显著差异。改良的系列抗病单基因系,可望用于配制稻瘟病抗性增强的两系杂交稻新组合;改良的抗病双基因聚合系,可在单基因系丧失抗性后应用于生产。
语种：
中文
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基于粳稻品种‘日本晴’的大穗大粒近等基因系评价
作者：
唐伟;孙博;周琪;曾盖;张菊萍;...
期刊：
作物研究 ,2017年31(3):222-227 ISSN：1001-5280
作者机构：
湖南农业大学农学院;水稻油菜抗病育种湖南省重点实验室;[肖应辉] 南方粮油作物协同创新中心;[叶乃忠; 唐伟; 孙博; 曾盖; 降好宇; 张菊萍; 周琪] 湖南农业大学
关键词：
水稻;穗粒数;粒型;近等基因系;日本晴
摘要：
为了筛选出理想的穗形、粒形近等基因系,对以粳稻品种‘日本晴’为背景亲本、以大穗品系‘R1126’和大粒品系‘TDX’为供体亲本构建的大穗、大粒株系进行了评价。结果表明:P01、P05、P09、P19和P20株系每穗粒数显著多于日本晴,而其他农艺性状与日本晴基本相当;G08和G09的粒重、粒长显著大于日本晴,而株高、穗长、每穗总粒数、结实率和单株粒重等性状与日本晴相当。这些株系是基于日本晴背景的理想大穗、大粒近等基因系,为后续的深入研究提供了基础材料。
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稻米垩白性状对高温耐性的QTL分析
作者：
张桂莲;廖斌;唐文帮;陈立云;肖应辉
期刊：
中国水稻科学 ,2017年31(3):257-264 ISSN：1001-7216
通讯作者：
Chen, L.
作者机构：
[廖斌; 唐文帮; 陈立云; 张桂莲; 肖应辉] College of Agronomy, Hunan Agricultural University, Changsha, 410128, China
通讯机构：
[Chen, L.] C;College of Agronomy, Hunan Agricultural University, Changsha, China
关键词：
稻米;垩白性状;高温耐性;数量性状基因座位
摘要：
【目的】本研究旨在筛选与稻米外观品质高温耐性连锁的分子标记,为稻米品质育种提供参考。【方法】以耐热水稻品系996和热敏感水稻品系4628为亲本构建的重组自交系为材料,采用垩白粒率耐热指数、垩白大小耐热指数和垩白度耐热指数为评价指标,对水稻垩白性状的高温耐性QTL进行检测。【结果】采用复合区间作图法两年共检测到垩白性状高温耐性QTL 24个,包括垩白粒率高温耐性QTL 8个,垩白大小高温耐性QTL 12个,垩白度高温耐性QTL 4个。其中,第6染色体上的2个垩白粒率高温耐性QTL和第7染色体上的2个垩白度高温耐性QTL在两年中重复检测到,且这2个稳定表达的垩白度位点与2015年检测到的第7染色体上的垩白粒率位点重合。另外,发现有4个QTL一因多效,同时影响垩白粒率、垩白大小及垩白度。【结论】控制垩白粒率耐热指数的qHTCGR6.1和控制垩白度耐热指数的qHTCD7.1是新的QTL。
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Dissection of the genetic architecture of rice resistance to the blast fungus Magnaporthe oryzae
作者：
Kang, Houxiang;Wang, Yue;Peng, Shasha;Zhang, Yanli;Xiao, Yinghui;...
期刊：
Molecular Plant Pathology ,2016年17(6):959-972 ISSN：1464-6722
通讯作者：
Wang, Guo-Liang
作者机构：
[Wang, Guo-Liang; Ning, Yuese; Zhang, Yanli; Peng, Shasha; Li, Zhiqiang; Liu, Wende; Kang, Houxiang] Chinese Acad Agr Sci, Inst Plant Protect, State Key Lab Biol Plant Dis & Insect Pests, Beijing 100193, Peoples R China.;[Xiao, Yinghui; Wang, Dan; Wang, Yue; Wang, Zhilong] Hunan Agr Univ, Hunan Prov Key Lab Crop Germplasm Innovat & Utili, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.;[Xiao, Yinghui; Wang, Dan; Wang, Yue; Wang, Zhilong] Hunan Agr Univ, Coll Agron, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.;[Qu, Shaohong] Zhejiang Acad Agr Sci, Inst Virol & Biotechnol, Hangzhou 310021, Zhejiang, Peoples R China.;[Yan, Shuangyong] Tianjin Acad Agr Sci, Tianjin Crop Res Inst, Tianjin 300112, Peoples R China.
通讯机构：
[Wang, Guo-Liang] C;[Wang, Guo-Liang] O;Chinese Acad Agr Sci, Inst Plant Protect, State Key Lab Biol Plant Dis & Insect Pests, Beijing 100193, Peoples R China.;Ohio State Univ, Dept Plant Pathol, Columbus, OH 43210 USA.
关键词：
genome-wide association study (GWAS);host resistance;QTL;rice blast;SNP
摘要：
Resistance in rice cultivars to the rice blast fungus Magnaporthe oryzae is complex and is controlled by both major genes and quantitative trait loci (QTLs). We undertook a genome-wide association study (GWAS) using the rice diversity panel 1 (RDP1) that was genotyped using a high-density (700 000 single nucleotide polymorphisms) array and inoculated with five diverse M. oryzae isolates. We identified 97 loci associated with blast resistance (LABRs). Among them, 82 were new regions and 15 co-localized with known blast resistance loci. The top 72 LABRs explained up to 98% of the phenotypic variation. The candidate genes in the LABRs encode nucleotide-binding site leucine-rich repeat (NBS-LRR) resistance proteins, receptor-like protein kinases, transcription factors and defence-related proteins. Among them, LABR_64 was strongly associated with resistance to all five isolates. We analysed the function of candidate genes underlying LABR_64 using RNA interference (RNAi) technology and identified two new resistance alleles at the Pi5 locus. We demonstrate an efficient strategy for rapid allele discovery using the power of GWAS, coupled with RNAi technology, for the dissection of complex blast resistance in rice.
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英文
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Genome-wide Association Mapping of Cold Tolerance Genes at the Seedling Stage in Rice
作者：
Wang, Dan;Liu, Jinling;Li, Chengang;Kang, Houxiang;Wang, Yue;...
期刊：
Rice ,2016年9(1):1-10 ISSN：1939-8425
通讯作者：
Xiao, Yinghui;Wang, Guo-Liang
作者机构：
[Deng, Yufei; Wang, Dan; Xiao, Yinghui; Wang, Guo-Liang; Liu, Jinling; Wang, Yue; Xiao, YH; Wang, GL; Wang, Zhilong; Liu, Minghao] Hunan Agr Univ, Southern Reg Collaborat Innovat Ctr Grain & Oil C, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.;[Deng, Yufei; Wang, Dan; Xiao, Yinghui; Wang, Guo-Liang; Liu, Jinling; Wang, Yue; Xiao, YH; Wang, GL; Wang, Zhilong; Liu, Minghao] Hunan Agr Univ, Coll Agron, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.;[Tan, Xinqiu; Li, Chengang; Zhang, Deyong; Liu, Yong] Hunan Acad Agr Sci, Inst Plant Protect, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.;[Kang, Houxiang] Chinese Acad Agr Sci, Inst Plant Protect, State Key Lab Biol Plant Dis & Insect Pests, Beijing 100193, Peoples R China.;[Wang, Guo-Liang] Ohio State Univ, Dept Plant Pathol, Columbus, OH 43210 USA.
通讯机构：
[Xiao, YH; Wang, GL] H;Hunan Agr Univ, Southern Reg Collaborat Innovat Ctr Grain & Oil C, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.;Hunan Agr Univ, Coll Agron, Changsha 410128, Hunan, Peoples R China.
关键词：
Oryza sativa;Cold tolerance;Quantitative trait locus (QTL);GWAS
摘要：
Background: Rice is a temperature-sensitive crop and its production is severely affected by low temperature in temperate and sub-tropical regions. To understand the genetic basis of cold tolerance in rice, we evaluated the cold tolerance at the seedling stage (CTS) of 295 rice cultivars in the rice diversity panel 1 (RDP1), these cultivars were collected from 82 countries. Results: The evaluations revealed that both temperate and tropical japonica rice cultivars are more tolerant to cold stress than indica and AUS cultivars. Using the cold tolerance phenotypes and 44 K SNP chip dataset of RDP1, we performed genome-wide association mapping of quantitative trait loci (QTLs) for CTS. The analysis identified 67 QTLs for CTS that are located on 11 chromosomes. Fifty-six of these QTLs are located in regions without known cold tolerance-related QTLs. Conclusion: Our study has provided new information on the genetic architecture of rice cold tolerance and has also identified highly cold tolerant cultivars and CTS-associated SNP markers that will be useful rice improvement. © 2016, The Author(s).
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英文
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水稻对减数分裂期高温胁迫的生理响应
作者：
张桂莲;蔡志欢;李波;廖斌;唐文帮;...
期刊：
杂交水稻 ,2016年31(3):64-67 ISSN：1005-3956
作者机构：
[张桂莲; 蔡志欢; 李波; 廖斌; 唐文帮; 肖应辉; 陈立云] 湖南农业大学农学院, 湖南, 长沙, 410128
关键词：
水稻;减数分裂期;高温;生理特性
摘要：
以水稻耐热品系996、热敏感品系4628为材料, 在减数分裂期进行高温处理, 以同期自然温度为对照, 研究减数分裂期高温对水稻花粉活力、花药开裂、受精率、结实性状及剑叶生理特性的影响。结果表明,高温处理显著降低了花粉活力、花药开裂系数、受精率、结实率,热敏感品系4628下降幅度大于耐热品系996;高温处理降低了热敏感品系4628米粒粒宽,增加了长宽比,对耐热品系996无显著影响;高温下剑叶叶绿素含量、SOD活性、POD活性降低,而MDA含量和相对电导率增加,热敏感品系4628变化幅度大于耐热品系996。
语种：
中文
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日本晴/R1126水稻重组自交系群体粒形性状QTL定位
作者：
叶乃忠;曾盖;唐伟;肖应辉
期刊：
华北农学报 ,2016年31(1):90-95 ISSN：1000-7091
作者机构：
[叶乃忠; 曾盖; 唐伟; 肖应辉] 湖南农业大学农学院, 南方粮油作物协同创新中心, 湖南, 长沙, 410128
关键词：
水稻;粒长;粒宽;粒厚;QTL定位
摘要：
为阐明大穗型籼稻品系R1126稻谷籽粒性状的遗传机制,以其与粳稻日本晴构建的重组自交系F_(10)为材料,通过连续2年田间种植并测定各株系的籽粒粒长、粒宽和粒厚等表型性状,结合利用SSR和SFP等分子标记构建的遗传图谱,对控制该群体的稻谷粒形性状进行了QTL分析。2年试验共检测到10个控制粒长、粒宽和粒厚性状的QTL,其中qGL3-1、qGL3-2和qGL9这3个粒长QTL,以及qGW2和qGW5这2个粒宽QTL在2年试验中能被重复检测;而粒厚性状在2年试验中检测到5个QTL,但均只在1年试验中出现。根据连锁的分子标记信息,qGL3-2、qGW2和qGW5可能分别与已报道的主要粒形基因GS3、GW2和GW5等位;而qGL3-1和qGL9可能为新的粒长QTL,且在2年试验中具有很好的重演性和稳定性,两者的加性效应均能使粒长增加0.2 mm以上,对于改善稻谷外观品质性状具有较好的潜在应用价值。
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适于晚季直播的早晚兼用型水稻品系筛选
作者：
曾盖;郝明;范科;安宁;唐伟;...
期刊：
湖南农业科学 ,2016年(8):12-15+18 ISSN：1006-060X
作者机构：
湖南农业大学农学院;[郝明; 范科] 北大荒垦丰种业股份有限公司;南方粮油作物协同创新中心;[唐伟; 肖应辉; 曾盖; 安宁] 湖南农业大学
关键词：
水稻;早晚兼用;晚季直播;双季稻
摘要：
以湖南农业大学选育的12个早稻品系以及对照品种株两优819、陆两优996、中早35和中早39为材料,采用早季栽插、晚季直播的方式,进行了早晚两季品系比较试验,对参试品种的产量、生育期和主要产量性状进行了比较分析.结果表明:选育的新品系早品15早季全生育期与迟熟对照陆两优996相当,晚季全生育期与对照品种中早35一致,且其全年产量1 077.1 kg/667m2,较对照品种中早35增产7.0％,该品系有望作为新种质用于培育早晚兼用型水稻品种或者审定后应用于生产.
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中文
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水稻镉积累的生理学和分子生物学机理研究进展
作者：
唐伟;肖应辉
期刊：
安徽农业科学 ,2016年44(27):4-9 ISSN：0517-6611
作者机构：
湖南农业大学农学院,湖南长沙,410128;湖南农业大学农学院，湖南长沙410128;南方粮油作物协同创新中心，湖南长沙410128;[唐伟; 肖应辉] 湖南农业大学
关键词：
水稻;镉积累;生理学;分子生物学
摘要：
深入了解水稻镉积累的生理学和分子生物学机制，有助于为制订稻米镉污染防控技术提供理论参考。概述了水稻镉吸收的影响因素及镉在水稻中的分布特征，介绍了水稻根部和地上部不同部位镉积累的生理学机制，综述了水稻镉积累有关的基因、数量性状位点（ QTL）和微小核糖核酸（ miRNAs）的研究进展。指出通过培育和推广镉低积累特性的水稻品种，是降低大米镉含量最经济有效的方法；并就通过分子标记辅助选择技术培育镉低积累特性的水稻两用核不育系的途径和技术展开了讨论。
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中文
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论杂交水稻的育种方法
作者：
陈立云;雷东阳;唐文帮;邓化冰;肖应辉;...
期刊：
湖南农业大学学报(自然科学版) ,2015年41(1):1-6 ISSN：1007-1032
作者机构：
湖南农业大学农学院,湖南长沙410128;[唐文帮; 雷东阳; 陈立云; 肖应辉; 邓化冰; 张桂莲] 湖南农业大学
关键词：
杂交水稻;育种;性状选择
摘要：
推广杂交水稻是增加粮食产量的最有效途径;杂交水稻育种是发展杂交水稻的技术核心;杂交水稻育种方法是决定其选育成效的关键。笔者近年在杂交水稻育种方面取得了一定成就,为了总结经验,便于交流,就杂交水稻育种所采用的方法进行回顾。探讨杂交水稻育种方向的确定方法和育种目标确定的原则,认为杂交水稻育种必须符合国家经济建设和社会发展需求,必须符合市场经济规律需求,必须符合企业盈利需求,必须符合未来发展需求;提出杂交水稻育种性状选择要做到＂全优、中庸、和谐＂,即双亲遗传距离适当,绝大部分性状的选择只选中间类型的,且所选性状要求达到与人和谐、与环境和谐以及性状之间相互和谐;高度重视亲本优良性状选择和杂交种性状全优;突出早发性、理想株形、抗倒性、高结实性、后期强功能性、稻米低垩白粒率等性状选择;必须人为创造或利用自然条件对一些重要性状进行增压选择;少种植育种材料和测交F1,多安排品比组合;特别重视品比试验的质量和准确性;注重品种审定规则及标准等。
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中国杂交水稻发展面临的挑战与策略
作者：
陈立云;雷东阳;唐文帮;邓化冰;肖应辉;...
期刊：
杂交水稻 ,2015年30(5):1-4 ISSN：1005-3956
作者机构：
[陈立云; 雷东阳; 唐文帮; 邓化冰; 肖应辉; 张桂莲] 湖南农业大学农学院
关键词：
杂交水稻生产;育种;规模化;机械化;可持续发展
摘要：
杂交水稻的推广应用为中国粮食安全作出了重大贡献,但近年来随着农业规模化、机械化的迅速发展,杂交水稻生产受到巨大冲击,种植面积减少,且有进一步下降的趋势。分析认为,阻碍中国杂交水稻发展的主要因素有:杂交水稻原有的产量优势、种子价格优势和育秧技术优势正在消失或不复存在,杂交水稻的某些主要性状不适应现代农业生产的要求,种田大户需求变化对杂交水稻提出了更高要求。针对这些问题,提出了相应的解决策略,一是通过培育超高异交结实率的不育系,筛选最佳制种基地和时段进行全程机械化制种,大幅度提高杂交稻制种产量和质量,把杂交稻种子生产成本降低50%; 二是政府部门、种子企业和科技人员要各司其职,在推进作物生产方式转型的同时,着力解决杂交水稻生产中存在的问题,确保杂交水稻可持续发展。
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